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lbambool木蟲 (著名寫手)
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[資源]
隨文獻(xiàn)下載的文本格式晶體結(jié)構(gòu)導(dǎo)入到MS的一種方法
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今天查文獻(xiàn)時(shí)下載了三個(gè)文本格式的晶體結(jié)構(gòu)文件,嘗試多種方法試圖導(dǎo)入到MS中一直不成功,多次嘗試后發(fā)現(xiàn),這個(gè)文本文件可用Diamond打開并存成cif文件,這個(gè)cif文件可以導(dǎo)入到MS里,但其中數(shù)據(jù)會(huì)缺失一部分,結(jié)構(gòu)不完整。網(wǎng)上搜索發(fā)現(xiàn)也有人說diamond導(dǎo)出的cif不能使用,嘗試導(dǎo)出成其他格式也不能直接導(dǎo)入到MS里。后來想起機(jī)上裝有CCDC,因發(fā)文章的作者多半會(huì)把結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)發(fā)給CCDC,于是嘗試用CCDC組件來處理。 1.先用Diamond打開并存成cif文件; 2.打開Mercury,用它再打開剛才的cif文件,可以看到與用CCDC顯示的結(jié)果相同,再用Mercury保存成cif文件; 3.用MS導(dǎo)入最后用mercury保存的cif文件可以完美顯示晶體結(jié)構(gòu)。 今天整整一個(gè)晚上都用來做這件事,小木蟲上也查到有人問同樣的問題,便把方法整理記錄下來,以便網(wǎng)友共享。 應(yīng)網(wǎng)友要求,加上主要步驟圖片,不過較多,放在一個(gè)文件里了,需要的自己下載一下吧,一個(gè)一個(gè)的貼太麻煩了,見諒。[ Last edited by lbambool on 2012-1-29 at 22:45 ] |
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LZ,你好,想請(qǐng)教一下,你在哪里下到的晶體結(jié)構(gòu)文件,例如我想下這篇文章對(duì)應(yīng)的晶體結(jié)構(gòu)文件,應(yīng)該在哪呢?http://www.sciencemag.org/content/319/5865/939 非常感謝 |
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