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wszjt1鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
【交流/求助】在用modeltest計(jì)算后的結(jié)果如何在paup下運(yùn)行 已有1人參與
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首先我用jmodeltest進(jìn)行模型分析，結(jié)果如下： ML optimized tree topology Model = TIM1+I+G partition = 012230 -lnL = 10949.8419 K = 90 freqA = 0.2772 freqC = 0.2322 freqG = 0.2240 freqT = 0.2666 R(a) [AC] = 1.0000 R(b) [AG] = 4.4136 R(c) [AT] = 0.5943 R(d) [CG] = 0.5943 R(e) [CT] = 5.2383 R(f) [GT] = 1.0000 p-inv = 0.0220 gamma shape = 1.0810 Computation time = 00h:00:32:08 (01h:04:24:08) 整理后為： Lset Base=(0.2772 0.2322 0.2241) Nst=6 Rmat=(1.0000 4.4136 0.5943 0.5943 5.2383) Rates=gamma Shape= 1.0810 Pinvar= 0.0220 然后打開(kāi)paup，雙擊38.nex文件。 如圖1；復(fù)制整理后內(nèi)容到paup內(nèi)的光標(biāo)處，單擊execute。如圖2.然后沒(méi)有任何反映，再輸入showtree，提示是there are no trees in memory.求教這是什麼情況啊，應(yīng)該怎么才能讓他畫出進(jìn)化樹(shù)�。�？？？ 1 2 |
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3樓2016-03-08 11:36:02
2樓2014-06-16 11:54:03
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