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cfmzxf84木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
求助，Amber10做并行出錯(cuò)，內(nèi)附代碼，希望前輩指教，謝謝
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用的是AMBER10自帶的lam 輸出錯(cuò)誤如下： The configuration file, config_amber.h, was successfully created. root@chen-Precision-WorkStation-490:/usr/local/amber10/src# make parallel Starting installation of Amber10 (parallel) at 2012年 02月 16日 星期四 22:00:24 CST. cd sander; make parallel make[1]: 正在進(jìn)入目錄 `/usr/local/amber10/src/sander' ./checkparconf cpp -traditional -I/usr/local/amber10/include -P -xassembler-with-cpp -Dsecond=ambsecond -DBINTRAJ -DMPI constants.f > _constants.f /usr/local/amber10/bin/mpif77 -c -O3 -fno-range-check -fno-second-underscore -ffree-form -o constants.o _constants.f make[1]: /usr/local/amber10/bin/mpif77：命令未找到 make[1]: *** [constants.o] 錯(cuò)誤 127 make[1]:正在離開(kāi)目錄 `/usr/local/amber10/src/sander' make: *** [parallel] 錯(cuò)誤 2 還有其他什么辦法做并行呢？謝謝各位了 |
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syhu_007012
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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2樓2012-02-17 09:00:07
godcook
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cfmzxf84(金幣+22): ★★★★★最佳答案 2012-02-20 12:56:20
cfmzxf84(金幣+22): ★★★★★最佳答案 2012-02-20 12:56:20
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make parallel的時(shí)候需要指定是用什么并行軟件，比如./configure -mpi gnu編譯。一般gnu編譯的amber是用openmpi管理并行。intel編譯的amber是用mpich2管理并行。 你這里的問(wèn)題應(yīng)該是你裝并行之前沒(méi)有make clean。不管裝并行還是裝串行，在裝完一個(gè)再裝另一個(gè)之前都要make clean一次。 |
3樓2012-02-19 18:37:15
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