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MS 結(jié)構(gòu)優(yōu)化的結(jié)果不能理解 求高人指點(diǎn)
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我研究的是TiO2，先切割一個(gè)面，加上真空層之后進(jìn)行優(yōu)化以看其穩(wěn)定性。第一幅是切割并處理好后的一個(gè)表面，后面一幅就是優(yōu)化之后的結(jié)果，個(gè)人感覺(jué)很不妥，為什么一開(kāi)始在一起，優(yōu)化完了卻分開(kāi)了，這明顯是破壞了晶格結(jié)構(gòu)，但是卻不能找出出錯(cuò)的原因。我已經(jīng)檢查，建模、切割所依據(jù)的參數(shù)都是對(duì)的，操作也無(wú)誤（或者還有隱藏的沒(méi)有被我發(fā)現(xiàn)的錯(cuò)誤），故求高人指點(diǎn)，感激不盡 優(yōu)化之前的 優(yōu)化之后的 [ 來(lái)自科研家族 夢(mèng)想家族 ] |
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
WDD880227(金幣+1): 感謝提示 2012-02-21 08:36:37
leachmond(金幣+2): ★有幫助 有幫助 如果能在接下來(lái)的問(wèn)題中回答的更詳細(xì) 加金幣獎(jiǎng)勵(lì) 2012-02-21 16:59:42
WDD880227(金幣+1): 感謝提示 2012-02-21 08:36:37
leachmond(金幣+2): ★有幫助 有幫助 如果能在接下來(lái)的問(wèn)題中回答的更詳細(xì) 加金幣獎(jiǎng)勵(lì) 2012-02-21 16:59:42
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我不知道你所說(shuō)的分開(kāi)是什么意思？你是指在盒子兩端都出現(xiàn)了Ti、O原子？如果是這樣，我覺(jué)得你得看看你目前的表面結(jié)構(gòu)，還是P1對(duì)稱性嗎？你在開(kāi)始優(yōu)化的時(shí)候，程序是否提醒，可以引入更高的對(duì)稱性優(yōu)化計(jì)算？而你又點(diǎn)了Yes。 退一步說(shuō)，你目前的結(jié)構(gòu)也沒(méi)有什么錯(cuò)誤，破壞晶體結(jié)構(gòu)實(shí)在危言聳聽(tīng)了，程序只是調(diào)整了重復(fù)單元的取法，你可以在Display style中選擇Lattice，在這個(gè)面板下面，調(diào)整顯示重復(fù)單元的數(shù)目，然后比較一下優(yōu)化前后的結(jié)構(gòu)，就能發(fā)現(xiàn)這一點(diǎn)。 |
3樓2012-02-20 23:00:57
8樓2012-02-22 09:17:16
shmilylxc
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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2樓2012-02-20 21:43:56
說(shuō)的詳細(xì)一點(diǎn)兒?jiǎn)h 4樓2012-02-21 16:58:13
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1、“分開(kāi)”指的就是優(yōu)化完了后，原本在一邊的原子分到兩邊了，因?yàn)楹竺孢�要做吸附，這樣沒(méi)有辦法操作，導(dǎo)師說(shuō)以前的結(jié)構(gòu)優(yōu)化沒(méi)有出現(xiàn)過(guò)這種情況，所以就覺(jué)得錯(cuò)了，讓我自己找原因（實(shí)際上他也不知道，對(duì)MS不是太懂）； 2、提交任務(wù)時(shí)確實(shí)有你說(shuō)的那個(gè)提醒，并且我確實(shí)是點(diǎn)擊了yes。剛剛看了我以前自己做的一些計(jì)算（就是自己算著玩的），關(guān)于TiO2的101面不同切割位點(diǎn)的計(jì)算，同樣點(diǎn)擊了出現(xiàn)了那個(gè)提示，并點(diǎn)了yes，結(jié)果大部分都正常，有一個(gè)和這次的問(wèn)題一樣——優(yōu)化后分開(kāi)了。不知道點(diǎn)擊了這個(gè)對(duì)結(jié)果有什么影響？如何矯正？是必須點(diǎn)no，還是說(shuō)有辦法通過(guò)一些操作，把這個(gè)問(wèn)題修正過(guò)來(lái)呢？； 3、“程序只是調(diào)整了重復(fù)單元的取法，你可以在Display style中選擇Lattice，在這個(gè)面板下面，調(diào)整顯示重復(fù)單元的數(shù)目，然后比較一下優(yōu)化前后的結(jié)構(gòu)，就能發(fā)現(xiàn)這一點(diǎn)。 ” 我和一位同道商量了一下，我們認(rèn)為優(yōu)化完之后的結(jié)構(gòu)，其重復(fù)單元的取法取決于其相應(yīng)的參數(shù)，既然取法變了，那么一些晶格參數(shù)也就變了。可能我們的理解有誤，，能不能說(shuō)的更加詳細(xì)一些。 |
5樓2012-02-21 17:19:19
6樓2012-02-21 19:24:11
7樓2012-02-22 07:25:35
賀儀
鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
9樓2012-02-22 11:05:59
WDD880227(金幣+1): 感謝交流提示 2012-02-23 13:57:34
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點(diǎn)擊了yes，就是允許程序自動(dòng)尋找當(dāng)前模型滿足的對(duì)稱性，結(jié)果就是，程序會(huì)給模型添加一個(gè)更高的對(duì)稱性，引入更高的對(duì)稱性不會(huì)對(duì)結(jié)構(gòu)本身產(chǎn)生太多影響，我指原子的位置，但是晶胞的選取，就是重復(fù)單元的選取，會(huì)依據(jù)所添加的對(duì)稱性作調(diào)整，所以，確實(shí)如你所說(shuō)，晶胞參數(shù)會(huì)變化，但是原子位置沒(méi)變，對(duì)于吸附的研究沒(méi)有明顯影響，不過(guò)，在表面添加吸附質(zhì)時(shí)會(huì)受到模型對(duì)稱性的影響，最好先Make P1. |
10樓2012-02-23 13:19:55
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