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hlq3175木蟲 (正式寫手)
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[求助]
【求助】guassian09中有關(guān)Cs 共面 CCSD(T)的問(wèn)題
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各位好，我是新手，現(xiàn)在老師讓我做一個(gè)計(jì)算，可是我?guī)缀鯖](méi)有接觸過(guò)，這個(gè)問(wèn)題是這樣的： 一種胺的結(jié)構(gòu)吸附CO2，我想要知道當(dāng)隨著CO2中C原子和胺中N原子的距離逐漸減小形成化學(xué)鍵過(guò)程中Relative energy 的變化，參考文獻(xiàn)過(guò)程中我遇到了以下問(wèn)題： （1）在優(yōu)化時(shí)必須是under the restriction of Cs structure,其中CO2和胺結(jié)構(gòu)中的五個(gè)原子必須共面，請(qǐng)問(wèn)我該怎樣做？我已經(jīng)試過(guò)了opt=modredundant,還有symm=pg=cs均不對(duì)。 （2）CCSD(T)能夠?qū)崿F(xiàn)我得到能量的目的嗎？我的理解是不同的距離下做CCSD(T),不知道這種思路對(duì)不對(duì)？拜托各位幫幫忙。 |
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zhou2009
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
hlq3175(金幣+2): ★有幫助 謝謝您，可是我們老師是要求我按照文獻(xiàn)重復(fù)一次，上面用的是這種辦法，所以能不能針對(duì)這個(gè)幫幫我。 2012-02-21 09:22:20
hlq3175(金幣+10): ★★★很有幫助 2012-02-25 23:19:21
hlq3175(金幣+2): ★有幫助 謝謝您，可是我們老師是要求我按照文獻(xiàn)重復(fù)一次，上面用的是這種辦法，所以能不能針對(duì)這個(gè)幫幫我。 2012-02-21 09:22:20
hlq3175(金幣+10): ★★★很有幫助 2012-02-25 23:19:21
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在Gaussian 09計(jì)算中，只有在命令行加上關(guān)鍵詞density才能得到相應(yīng)的輸出：Natural Orbital Coefficients。否則只會(huì)輸出相同基組的RHF的結(jié)果：Molecular Orbital Coefficients。 但在Gaussian 09中，CCSD(T) 不支持生成密度信息，加關(guān)鍵詞density，會(huì)出錯(cuò)，出錯(cuò)信息會(huì)提示可以作density的一些方法，如CCD�？梢杂民詈洗胤椒ǖ腃CD加關(guān)鍵詞density來(lái)得到密度。CCD在考慮電子相關(guān)和電子密度計(jì)算上是足夠精確的。 [ Last edited by zhou2009 on 2012-2-21 at 08:52 ] |
3樓2012-02-21 08:18:01
dreamyeye
木蟲 (著名寫手)
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hlq3175(金幣+1): ★有幫助 嗯，那個(gè)耗時(shí)我是知道的，不過(guò)老師讓我要重復(fù)文獻(xiàn)的實(shí)驗(yàn)過(guò)程，所以我能選的只有這個(gè)。 2012-02-21 09:23:43
hlq3175(金幣+1): ★有幫助 嗯，那個(gè)耗時(shí)我是知道的，不過(guò)老師讓我要重復(fù)文獻(xiàn)的實(shí)驗(yàn)過(guò)程，所以我能選的只有這個(gè)。 2012-02-21 09:23:43
| PG=group 是使用指定點(diǎn)群以下的對(duì)稱性，ccsd（T）非常耗時(shí)，能不能用其他的一些方法啊，比如DFT之類的，而且有文章說(shuō)包含電子相關(guān)的方法處理平面結(jié)構(gòu)往往會(huì)使平面不能保持。 |
2樓2012-02-21 00:53:08
zhou2009
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hlq3175(金幣+8): ★★★很有幫助 謝謝您，我想問(wèn)一下您對(duì)第一個(gè)問(wèn)題能給我一點(diǎn)解答嗎？就是如何在畫圖過(guò)程中體現(xiàn)它是Cs對(duì)稱，并且能保證幾個(gè)原子是共面的？ 2012-02-21 17:41:09
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可以在不同的距離下做CCD（加關(guān)鍵詞density)。 還要注意適當(dāng)?shù)幕M相配合。 不知道你的那種胺的結(jié)構(gòu)有多大，CCD加合適的基組計(jì)算量是很大很大的。 但如果用考慮電子相關(guān)不周的方法，Relative energy 是算不準(zhǔn)的。 |
4樓2012-02-21 09:59:38
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