| 查看: 4080 | 回復: 13 | ||
wohaihao榮譽版主 (著名寫手)
保密局的……
|
[求助]
請教高人,我的pymol軟件導入蛋白后進行cartoon時,出現(xiàn)的怎么是loop結(jié)構(gòu)?
|
|
|
教程說應該是cartoon_automatic 那種,很漂亮的。 我用了cartoon automatic命令也不識別,一直是loop結(jié)構(gòu)。 其他的都能掉出來,如arrow等。請教這個默認設(shè)置怎么弄?或者是軟件本身的問題? |

木蟲 (正式寫手)
|
你使用pymol將蛋白和小分子分別存出來為pdb格式,然后將這兩個文件合并起來,就可以了。將connect的行去掉,將第一個end改成ter,就可以了 附件為我改過的文件,你可以看下 |
金蟲 (小有名氣)
榮譽版主 (著名寫手)
保密局的……

榮譽版主 (著名寫手)
保密局的……

木蟲 (正式寫手)
榮譽版主 (著名寫手)
保密局的……

榮譽版主 (著名寫手)
保密局的……
| 附件中的文件是我用sybyl保存過的,在pymol里面可以做成各種形式的cartoon,如loop等,就是不能得到第一幅圖的那種形式,請大家?guī)兔υ囋? |

木蟲 (正式寫手)
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 調(diào)劑申請 +4 | 張張張張zy 2026-03-31 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 070300一志愿211,312分求調(diào)劑院校 +6 | 小黃鴨寶 2026-03-30 | 6/300 |
|
|
[考研]
|
Gymno 2026-03-30 | 6/300 |
|
|
[考研] 359求調(diào)劑 +5 | 王了個楠 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
[考研] 085600 材料與化工 329分求調(diào)劑 +18 | Mr. Z 2026-03-25 | 19/950 |
|
|
[考研]
|
gr哈哈哈 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +10 | 宋明欣 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
[考研] 化學0703 調(diào)劑 306分 一志愿211 +8 | 26要上岸 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
[考研] 324求調(diào)劑 +9 | hanamiko 2026-03-26 | 11/550 |
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +6 | Amber00 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
[考研] 2026年華南師范大學歡迎化學,化工,生物,生醫(yī)工等專業(yè)優(yōu)秀學子加入! +3 | llss0711 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
[考研] 279求調(diào)劑 +4 | 蝶舞輕繞 2026-03-29 | 4/200 |
|
|
[考研] 數(shù)一英一271專碩(085401)求調(diào)劑,可跨 +7 | 前行必有光 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
[考研] 0703化學求調(diào)劑,各位老師看看我!! +5 | 祁祺祺 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
[考研] 一志愿211院校 344分 東北農(nóng)業(yè)大學生物學學碩,求調(diào)劑 +5 | 丶風雪夜歸人丶 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
[考研] 08開頭275求調(diào)劑 +4 | 拉誰不重要 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +9 | 小蠟新筆 2026-03-26 | 9/450 |
|
|
[考研] 0703化學一志愿南京師范大學303求調(diào)劑 +3 | zzffylgg 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +6 | Ymlll 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
[考研] 總分322求生物學/生化與分子/生物信息學相關(guān)調(diào)劑 +5 | 星沉uu 2026-03-26 | 6/300 |
|