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年年年2011銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助:DGGE新手,基本問題求助,請(qǐng)教各位高手
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各位大俠,才開始了解做DGGE,有些問題一直沒明白,金幣不多,但請(qǐng)多多指教啊,不甚感激! 背景:現(xiàn)在要分析一個(gè)未知環(huán)境的微生物多態(tài),求其組成 我想請(qǐng)教下幾個(gè)基本問題: 1.怎么在NCBI上查到細(xì)菌16S rDNA的所有通用引物? 2.通用引物最終選擇哪一對(duì)呢?看到文獻(xiàn)有很多對(duì),各自的選擇都不一樣,一般選擇根據(jù)什么依據(jù)呢?謝謝哈 3.怎么加GC序列,那個(gè)是自己用軟件算嗎? |
新蟲 (初入文壇)
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引物序列給你,直接在公司合成就可以。 細(xì)菌16S rDNA V3 region 194 bp 338F:5-CCT ACG GGA GGC AGC AG-3 518 R:5-ATT ACC GCG GCT GCT GG-3 GC338F:5-CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGGCGGGGCGGGGGCGCGGGGGG CCT ACG GGA GGC AGC AG-3 |
鐵蟲 (初入文壇)
銅蟲 (小有名氣)
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