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[求助]
Gamess 能量分解的輸入文件
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| 各位大蝦，本人想用Gamess做一個(gè)二聚體的能量分解，由于沒(méi)有接觸過(guò)此軟件，不知如何編寫(xiě)輸入文件，還有能量分解的方法也不了解，請(qǐng)大家賜教，在此急求能量分解的輸入文件和輸出文件的例子，及能量分解方法的種類和選取辦法 |
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liuhuisfp
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slay3: 回帖置頂 2012-09-14 13:53:05
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上面的例子是比較復(fù)雜的，考慮的PCM效應(yīng)的，現(xiàn)在GAMESS官方程序中還沒(méi)有，我們老板剛開(kāi)發(fā)完（相應(yīng)文章已被JCP接收）。所以你計(jì)算的時(shí)候不需要$PCM和$PCMCAV參數(shù)。 最為重要的是$CONTRL中的 runtyp=eda，用于說(shuō)明你是進(jìn)行EDA（能量分解）計(jì)算 然后是 $LMOEDA， 這一項(xiàng)用于設(shè)定EDA相應(yīng)的參數(shù)： matom(1)=9 1 說(shuō)明將下面的體系分為兩個(gè)block，前一個(gè)block包含9個(gè)原子（前9個(gè)）；后一個(gè)block包含一個(gè)原子（即Cu)，計(jì)算這兩個(gè)block間的相互作用能，并進(jìn)行分解。需要注意的是一定不能讓block間的原子交錯(cuò)。不錯(cuò)結(jié)果一定是錯(cuò)的。 mcharg(1)=0 1 用于定義兩個(gè)block所帶的電荷。此例子中，第一個(gè)不帶電，第二個(gè)CU為+１價(jià)； mmult(1)=1 1 定義兩個(gè)block的多重度。此例子中兩個(gè)BLOCK均為閉殼層，所以設(shè)定為1。 supbas=.t. 進(jìn)行BSSE消除計(jì)算，這個(gè)默認(rèn)選項(xiàng)，可以不寫(xiě)。 其它的一此參數(shù)與$BASIS, $SCF, SSYSTEM都是根據(jù)實(shí)際需要調(diào)整的 |
3樓2012-07-15 19:41:17
liuhuisfp
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【答案】應(yīng)助回帖
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不清楚你體系是什么……我在這里給一個(gè)用LMOEDA做能量分解的例子： $contrl scftyp=rhf runtyp=eda dfttyp=b3lyp1 $end $contrl icharg=1 mult=1 ispher=1 $end $lmoeda matom(1)=9 1 mcharg(1)=0 1 mmult(1)=1 1 supbas=.t. $end $basis gbasis=cct $end $pcm solvnt=water $end $pcmcav alpha=1.1 $end $pcmcav rin(1)=1.926 rin(2)=2.018 rin(3)=1.926 rin(4)=1.443 $end $pcmcav rin(5)=1.443 rin(6)=1.443 rin(7)=1.443 rin(8)=1.443 $end $pcmcav rin(9)=1.443 rin(10)=1.748 $end $tescav ntsall=240 mthall=4 $end $scf diis=.t. soscf=.f. dirscf=.t. fdiff=.f. npunch=1 ethrsh=100 $end $system mwords=100 memddi=600 $end $data itle: 1 C 6.0 10.1942801565 48.6863306161 32.3481462225 S 16.0 10.3578593780 50.3645238138 33.0032994531 C 6.0 8.7849632260 51.0813218166 32.4700178815 H 1.0 9.3667191827 48.2198062710 32.8775002151 H 1.0 11.1144700756 48.1540385817 32.5734553514 H 1.0 8.6596670994 50.9919698765 31.3954506977 H 1.0 7.9988865414 50.5450972368 32.9965472141 H 1.0 8.7786391502 52.1244074795 32.7745939847 H 1.0 10.0084600746 48.7010866606 31.2787325421 CU 29.0 11.9147019946 51.3366703824 31.8673297512 $end 先回，下面解釋參數(shù) |
2樓2012-07-15 19:29:00
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