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wuhaigang

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[交流] 有關(guān)autodock發(fā)文章的問(wèn)題

我最近很頭疼論文的問(wèn)題，我現(xiàn)在精通的軟件就是autodock而已，但是，畢竟身邊沒(méi)有什么牛人能給我點(diǎn)思路。我想問(wèn)一下大家，用autodock怎么發(fā)文章的啊，當(dāng)然就只是CADD方面的，其他的，像只是在論文中修飾的就算了。

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1樓 2012-02-28 16:23:14

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gouyi

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2樓2012-02-28 23:03:40

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huang0106

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將對(duì)接最好的結(jié)果（一般是打分）用pymol處理

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3樓2012-02-29 00:04:08

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wuhaigang

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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3樓: Originally posted by huang0106 at 2012-02-29 00:04:08:
將對(duì)接最好的結(jié)果（一般是打分）用pymol處理

我現(xiàn)在基本上不用pymol作為處理軟件了，我看很多的文獻(xiàn)上已經(jīng)開(kāi)始用UCSF的chimera作為結(jié)果處理了，而且比pymol方便點(diǎn)吧。

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4樓2012-02-29 08:23:17

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chuannong

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LZ既然是精通，應(yīng)該看了不少相關(guān)文獻(xiàn)，應(yīng)該也有想法吧

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5樓2012-02-29 20:36:41

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wuhaigang

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5樓: Originally posted by chuannong at 2012-02-29 20:36:41:
LZ既然是精通，應(yīng)該看了不少相關(guān)文獻(xiàn)，應(yīng)該也有想法吧

我又一點(diǎn)想法，但是都是很簡(jiǎn)單的，也不知道做出來(lái)之后是什么水平的文章。

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6樓2012-02-29 21:20:10

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tinasheen

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有了想法就先做做看呀，一般都是一邊做一邊思考，最后會(huì)越做越深入，自然也能發(fā)表好的文章了。樓主加油呀

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7樓2012-03-06 09:22:19

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luckydong1

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樓主，我現(xiàn)正在學(xué)習(xí)autodock，非常頭疼。按照tutorial準(zhǔn)備所需要的文件后，運(yùn)行autodock竟然說(shuō)“autodock4: can't create log file LMGWHÿÿÿ.dlg
autodock4: Unsuccessful Completion.” 這怎么回事�。课以驹O(shè)置的log文件名是LMGWH.dlg的。教教我吧

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8樓2012-03-06 16:27:25

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wuhaigang

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8樓: Originally posted by luckydong1 at 2012-03-06 16:27:25:
樓主，我現(xiàn)正在學(xué)習(xí)autodock，非常頭疼。按照tutorial準(zhǔn)備所需要的文件后，運(yùn)行autodock竟然說(shuō)“autodock4: can't create log file LMGWHÿÿÿ.dlg
autodock4: Unsuccessful Completi ...

It is the problem of your files.Maybe you create the files in window operation system,but load in linux system . So I give some opinions : though the chimera in linux or chemoffice in windows ,remember that there must not be some chinese or other words in your files.

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9樓2012-03-07 08:34:01

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簡(jiǎn)單回復(fù)

longytu10樓

2012-04-02 17:20 回復(fù)

小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
chaizhm: 編輯內(nèi)容 2012-04-02 18:45

1 [ Last edited by chaizhm on 2012-4-2 at 18:45 ]

longytu11樓

2012-04-02 17:22 回復(fù)

小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

好 [ Last edited by longytu on 2012-4-3 at 08:25 ]

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