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friendy銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
急求fftw3.3.1安裝問題，解答
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我最近用cygwin安裝gromacs。但是在安裝fftw3.3.1的時候出現(xiàn)問題。 1）安裝過程中沒有報錯。但是在安裝gromacs4.4.5，./configure 提示錯誤，cannot find fftw3f library. cygwin， gromacs ,fftw都 是從官網(wǎng)下載的 fftw我是安裝的我自定義的文件夾下。 路徑用setenv 命令做了設(shè)置。 2)我查看了下fftw 下/include /lib 文件夾，發(fā)現(xiàn)安裝后文件很少，沒有看到fftw3f為文件名的文件。 我查看了下fftw3.3.1 解壓后的文件，也沒有看到fftw3f文件名的文件 請高手指點下 另外我在redhat9.0下安裝gromacs4.4.5也出現(xiàn)了同樣的問題。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm(金幣+3): 2012-03-02 14:13:29
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm(金幣+3): 2012-03-02 14:13:29
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幾點建議: (1) cygwin不是長久之道, 建議直接ubuntu http://www.ubuntu.com/ (2) 請將安裝fftw和gromacs的步驟貼出來, 這樣大家才好幫你看到底哪里出了問題. 一般而言, 安裝完成以后, lib下面需要libfftw3.a 和 libfftw3f.a, 看你是不是單精度雙精度都安裝 . |
2樓2012-03-02 09:02:49
friendy
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安裝過程是這樣的 fftw 1）./configure --enable-float --enable-threads --enable-sse --enable-sse2 --prefix=/home/fftw 2)make 3)make install setenv cppflags -i/home/fftw/include setenv ldflags -l/home/fftw/lib gromacs 1)./configure --enable-float --prefix=/home/gromacs error cannot find fftw3f library 這就是我的安裝過程，都是參照網(wǎng)上的建議做的。一前我使用的是gromacs3版本的，都沒有出現(xiàn)過這個問題。因為科研的需要，要用到升級版本。但是這個問題一直解決不了。 文件libfftw3.a我有的 |
3樓2012-03-02 09:55:49
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5樓2012-03-02 10:40:42
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6樓2012-03-02 10:46:42
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嗯, 怪不得呢. 確定一下, 在命令行下面, 輸入 echo $SHELL 如果是bash, 那么設(shè)置環(huán)境變量的命令是, export CPPFLAGS="-I/home/fftw" export LDFLAGS="-L/home/fftw" 如果是csh或者tcsh 那么, setenv CPPFLAGS -I/home/fftw setenv LDFLAGS -L/home/fftw 記得, 設(shè)置好環(huán)境變量以后, 再double check一下: echo $CPPFLAGS echo $LDFLAGS 看看是不是設(shè)置成功了. 至于360和金山, 我就只能冒汗了....... 你自己看著辦吧..... |
7樓2012-03-02 10:51:08
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9樓2012-03-02 10:54:12
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10樓2012-03-02 11:15:34
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