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zhangguangping木蟲 (著名寫手)
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[資源]
MPI的安裝(管理員和普通用戶均可)
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本版塊有的蟲友在尋找MPI的安裝，我現(xiàn)在把我以前的安裝筆記分享出來，這兒以MPICH2和OpenMPI為例子，并且由于筆記比較早，所以版本有些老，對于新版本的安裝，大家可以做一下參考。 下面的安裝都是以普通用戶為例子，如果是root用戶安裝，流程一樣。 （一）MPICH2的安裝 (各種版本的下載地址http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/) 1.將mpich-1.2.7.tar.gz文件拷貝到一個臨時的目錄里面（如tem） 2.解壓文件：$tar -zxvf mpich-1.2.7.tar.gz 3.進入解壓后的目錄：$cd mpich-1.2.7 4. $./configure -prefix=/home/zgp/software/mpich-1.2.7 -fc="pgf77 -Mx,119,0x200000"\ -f90="pgf90 -Mx,119,0x200000"\ -without-romio --without-mpe -opt=-O -rsh=ssh (若要使用的是ifort編譯則設(shè)置成$./configure -prefix=/home/zgp/software/mpich-1.2.7 -fc=ifort -f90=ifort –f77=ifort -rsh=ssh) 5. $make 6. $make install 7環(huán)境配置：vi ~/.bashrc (打開文件.bashrc，按i進入編輯狀態(tài)) 添加export PATH=/home/zgp/software/mpich-1.2.7/bin:$PATH 關(guān)閉之后 source ~/.bashrc(使設(shè)置起作用，以后再新進入shell之后直接可以用mpirun) 8.測試：$cd examples $make $mpirun –np 4 cpi ################## 注：下面的這個如果提前對用戶配置好免SSH登錄的話，就不會出現(xiàn)了，所以建議首先對用戶配置免SSH登錄，如果是root的SSH免密碼登錄已經(jīng)配置好了的話，普通用戶只需要進行如下操作即可： ssh-keygen -t rsa 后面直接連著三個“Enter”就可以， 然后運行命令： cat ~/.ssh/id_rsa.pub >> ~/.ssh/authorized_keys ###################### $The authenticity of host 'localhost (127.0.0.1)' can't be established. RSA key fingerprint is c0:48:84:0c:31:93:29:9a:d6:f6:07:08:7b:cc:33:db.Are you sure you want to continue connecting (yes/no)? $yes $Warning: Permanently added 'localhost' (RSA) to the list of known hosts. $zgp@localhost's password: 這時連續(xù)輸入3次密碼出現(xiàn) $Process 0 on localhost Process 2 on localhost Process 3 on localhost Process 1 on localhost pi is approximately 3.1416009869231249, Error is 0.0000083333333318 wall clock time = 0.003906 表明安裝成功。要想無密碼并行，參考“ssh 免密碼登錄設(shè)置” 注意：mpich卸載，用/sbin/mpiuninstall文件 （二）OpenMPI的安裝 (各種版本下載地址：http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.4/) 1.將openmpi-1.2.6.tar.gz文件拷貝到一個臨時的目錄里面（如tem） 2.解壓文件：$tar -zxvf openmpi-1.2.6.tar.gz 3.進入解壓后的目錄：$cd openmpi-1.2.6 4.$ ./configure --prefix=/home/zgp/software/openmpi-1.2.6 F77=ifort FC=ifort (./configure --prefix=/home/zhangp/software/openmpi-1.4.3 CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort FFLAGS=-i8 FCFLAGS=-i8) –i8參數(shù)是使用Intel編譯器編譯64位的編譯參數(shù)，否則是32位的。 關(guān)于OpenMPI的編譯說明詳見官網(wǎng)http://www.open-mpi.org/faq/?category=building#easy-build 5.$make all install 6. 環(huán)境配置：vi ~/.bashrc (打開文件.bashrc，按i進入編輯狀態(tài)) 添加export PATH=/home/zgp/software/openmpi-1.2.6/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH: /home/zgp/software/openmpi-1.2.6/lib 關(guān)閉之后 source ~/.bashrc(使設(shè)置起作用，以后再新進入shell之后直接可以用mpiexec) 注意：openmpi卸載，可以直接刪除安裝文件 關(guān)于建立一個64位的OpenMPI，參考http://wiki.chem.vu.nl/dirac/ind ... for_64-bit_integers 為了防止該網(wǎng)址失效（曾經(jīng)是效果，這個是我又重新找的，我將網(wǎng)頁保存下來放到附件里面去了）[ Last edited by zhangguangping on 2012-3-5 at 15:50 ] |
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2012-03-05 15:48:50, 126.4 K
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9樓2012-03-07 11:28:25
4樓2012-03-05 21:41:08
zhangguangping
木蟲 (著名寫手)
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