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[交流] ClustalW結(jié)果分析的小問(wèn)題一個(gè)

ClustalW得到的結(jié)果中有星號(hào)（*）、冒號(hào)（：）、句號(hào)（.），星號(hào)和冒號(hào)都算高度保守的吧？還是只有星號(hào)算？

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1樓 2012-03-06 09:33:59

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求解答~~

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2樓2012-03-06 15:45:39

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amisking(金幣+2): 鼓勵(lì)發(fā)帖交流！ 2012-03-06 19:40:58

好歹說(shuō)清楚用clustalW做什么分析啊……這款軟件能搞的東西比較多，你這問(wèn)題沒(méi)頭沒(méi)腦，至少我是無(wú)法回答的。

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3樓2012-03-06 17:12:40

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引用回帖:

樓: Originally posted by sheepyuan at 2012-03-06 17:12:40:
好歹說(shuō)清楚用clustalW做什么分析啊……這款軟件能搞的東西比較多，你這問(wèn)題沒(méi)頭沒(méi)腦，至少我是無(wú)法回答的。

暈……當(dāng)然是多序列比對(duì)了，這貌似是這軟件最常用的功能吧。。。

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4樓2012-03-07 09:02:35

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只有*是相同的意思

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5樓2012-03-07 09:33:58

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引用回帖:

樓: Originally posted by 小小微生物 at 2012-03-07 09:33:58:
只有*是相同的意思

恩，對(duì)的，但“：”也是高度保守的吧。

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6樓2012-03-07 10:23:26

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原文鏈接：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/help/faq.html#20b
--------------------------------------------------------------------------------------
An * (asterisk) indicates positions which have a single, fully conserved residue.
A : (colon) indicates conservation between groups of strongly similar properties - scoring > 0.5 in the Gonnet PAM 250 matrix.
A . (period) indicates conservation between groups of weakly similar properties - scoring =< 0.5 in the Gonnet PAM 250 matrix

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7樓2012-04-03 19:24:08

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　　“-”表示缺失。
　　“*”表示參與比對(duì)的序列在該位點(diǎn)是完全一致的。
　　“：”表示在該列序列可以觀察到保守的替換。
　　“.”表示在該列序列可以觀察到半保守的替換。

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8樓2013-03-04 21:13:01

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“*” 表示序列上100%的保守區(qū)域
“：” 代表保守替換
“.” 代表非保守替換

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9樓2013-07-01 16:27:49

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