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daiyulan85木蟲 (正式寫手)
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[求助]
這種激發(fā)態(tài)掃描圖是怎么做的（Linear interpolation step不知道具體是指什么）
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如題，看起來應該是橫坐標是掃描的步數(shù)，但是這個Linear interpolation step具體是指什么呢？google查到了Linear interpolation 的意思（Linear interpolation is a method of curve fitting using linear polynomials），僅僅是設定某一個參數(shù)進行激發(fā)態(tài)掃描嗎？求解。 Energies of the S0,S1,S2,S3 excited states along the LIIC connecting the FCpoint to the S1(2APB) for 5’-2APT-3' |
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【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數(shù) +1
gmy1990(金幣+3): 2012-03-07 11:26:28
daiyulan85(金幣+10): ★★★很有幫助 2012-03-07 17:00:36
感謝參與，應助指數(shù) +1
gmy1990(金幣+3): 2012-03-07 11:26:28
daiyulan85(金幣+10): ★★★很有幫助 2012-03-07 17:00:36
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這個是在第一個構型和最后一個構型的所有內(nèi)坐標（3N-6個）之間插值掃描出來的。 比如第一個構型的某個鍵長為1.2，而最后一個構型的該鍵長為1.3，那么中間9個點的構型該鍵長為1.21,1.22,1.23,1.24,1.25,1.26,1.27,1.28,1.29。依次類推，對所有的3N-6個坐標都做一樣的處理。 這個實現(xiàn)起來也很簡單，只需要知道第一個結構和最后一個結構的Z-Matrix，然后對Z-Matrix中的3N-6個值進行差值即可。 幾點注意事項：第一個結構和最后一個結構的Z-Matrix中的原子序號和內(nèi)坐標必須完全一致；鍵長和鍵角可以之間用N_start+（N_end-N_start)/n*i 的方式來處理，但是二面角不可以這么處理，需要根據(jù)差值的大小做一點特殊處理，否則插值出來的結構就會完全亂套，幾個原子會完全擠在一起。 |
5樓2012-03-07 10:22:05
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
御劍江湖(金幣+4): 呵呵，謝謝 2012-03-08 19:26:36
感謝參與，應助指數(shù) +1
御劍江湖(金幣+4): 呵呵，謝謝 2012-03-08 19:26:36
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All intermediate geometries were produced by the equation Q i =Qi (r) + n .{Qi (p) -Q i (r)}, where Qi (r) is any coordinate of the reactant, and Qi(p) is the same coordinate of the product – in this case the conical intersection. The interpolation parameter e is changed in the interval from 0 (for reactant) to 1 (for product – conical intersection S0–S1 ) with a step of 0.1. 也就是把產(chǎn)物的坐標減去反應物的坐標，然后n等分這個值，再一份一份的把這個等分的值加上反應物的坐標，就是要的每個狀態(tài)的坐標了 |
7樓2012-03-07 18:59:47
daiyulan85
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