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04nylxb木蟲 (正式寫手)
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[求助]
請(qǐng)教torque該如何設(shè)置隊(duì)列或是任務(wù)或是用戶優(yōu)先級(jí)？以及調(diào)用哪些node
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各位同仁，用torque進(jìn)行任務(wù)管理，無maui，請(qǐng)問該如何設(shè)置優(yōu)先級(jí)？我看torque手冊(cè)，是否可以通過設(shè)置，隊(duì)列、任務(wù)、以及用戶組來設(shè)置優(yōu)先級(jí)？ 比如通過隊(duì)列，創(chuàng)建一個(gè)隊(duì)列，通過priority控制優(yōu)先級(jí) # qmgr –c “set queue queuename priority=20”（默認(rèn)是0，手冊(cè)只說是取整數(shù)，是正數(shù)優(yōu)先級(jí)高還是負(fù)數(shù)優(yōu)先級(jí)高呢？ 0的優(yōu)先級(jí)還是20的優(yōu)先級(jí)高呢？還是可以設(shè)置-20，是最高優(yōu)先級(jí)？） 也可以在Pbs腳本里面設(shè)定， #pbs -l nice=integer (-20優(yōu)先級(jí)最高，19優(yōu)先級(jí)最低) 腳本還可以通過這樣控制優(yōu)先級(jí) #pbs –p -1024 (-1024到1023，是否是負(fù)值越大，優(yōu)先級(jí)越高？) 或者是否可以通過設(shè)定用戶的優(yōu)先級(jí)？（手冊(cè)上貌似沒說） 請(qǐng)教下大家，隊(duì)列優(yōu)先級(jí)和腳本優(yōu)先級(jí)，哪個(gè)更高些？ 還有是否可以通過設(shè)定nodes文件后面的Node跟的隊(duì)列，來指定某個(gè)隊(duì)列調(diào)用哪些nodes？ 如 node-2 queue01 node-3 queue01 node-4 queue02 是否可以指定，queue01只能調(diào)用node-2 跟3，queue02只能調(diào)用node-4？ queue03 (沒有指定)，是否可以調(diào)用全部nodes？ 非常感謝。 |
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6樓2012-03-15 20:59:47
zhangguangping
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【答案】應(yīng)助回帖
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cenwanglai: 金幣+2, 隨禮~~ 2012-03-15 19:13:13
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對(duì)于第一個(gè)問題，現(xiàn)在沒有研究。我使用的Torque+Maui，但是對(duì)于你的第二個(gè)問題：隊(duì)列和節(jié)點(diǎn)的映射問題，可以提供一個(gè)思路。具體可以參見：http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=4065399&fpage=1，估計(jì)你看過，可能被開頭的Torque+Maui嚇到了，以為下面找不到你要的東西。其實(shí)那個(gè)帖子在最后的實(shí)現(xiàn)上與Maui無關(guān)，不妨一試。 現(xiàn)摘抄如下： 1.修改/var/spool/torque/server_priv/nodes文件 node01 np=12 sugon siesta dalton gaussian node02 np=12 sugon siesta dalton gaussian node03 np=12 sugon siesta dalton gaussian node04 np=12 sugon siesta dalton gaussian node05 np=12 sugon siesta dalton gaussian node06 np=12 sugon siesta dalton gaussian node07 np=12 sugon siesta dalton gaussian node08 np=12 sugon siesta dalton gaussian node09 np=12 sugon siesta dalton gaussian node10 np=12 sugon siesta dalton gaussian node11 np=12 sugon siesta dalton gaussian node12 np=12 sugon siesta dalton gaussian node31 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node32 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node33 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node34 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node35 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node36 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node38 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node39 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node40 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node41 np=8 dell siesta dalton gaussian others node42 np=8 dell siesta dalton gaussian others node43 np=8 dell siesta dalton gaussian others node44 np=8 dell molpro node45 np=8 dell molpro node46 np=8 dell molpro 將每一個(gè)節(jié)點(diǎn)分配上屬性，每一個(gè)節(jié)點(diǎn)可以加多個(gè)屬性，這一點(diǎn)是該方法成功的關(guān)鍵所在。 2.然后創(chuàng)建一系列的隊(duì)列，并且指定隊(duì)列只接受哪個(gè)用戶組的任務(wù)，為了簡(jiǎn)單起見，每一個(gè)用戶組創(chuàng)建一個(gè)相似的隊(duì)列。然后給隊(duì)列指定默認(rèn)的資源。 舉一例如下： 創(chuàng)建siesta用戶對(duì)應(yīng)的隊(duì)列SIESTA qmgr -c "create queue SIESTA queue_type=execution" 創(chuàng)建SIESTA隊(duì)列，并且指定類型為execution qmgr -c "set queue SIESTA started=true" 指定SIESTA隊(duì)列中的任務(wù)可以被調(diào)度執(zhí)行 qmgr -c "set queue SIESTA enabled=true" 指定SIESTA隊(duì)列可以接受新的任務(wù) qmgr -c "set queue SIESTA acl_group_enable=true" 指定SIESTA隊(duì)列專屬某一個(gè)用戶組 qmgr -c "set queue SIESTA acl_groups=siesta" 指定SIESTA隊(duì)列的專屬用戶組為siesta用戶組，只有屬于siesta用戶組的用戶才能向改隊(duì)列中提交任務(wù)，其他的用戶組不可以。當(dāng)然，一個(gè)用戶可以屬于多個(gè)用戶組。 qmgr -c "set queue SIESTA acl_group_sloppy=true" 指定是不是只看用戶的第一用戶組來決定對(duì)隊(duì)列的使用權(quán)。如果該項(xiàng)沒有，則只有第一用戶組為siesta的用戶組才能向該隊(duì)列對(duì)提交任務(wù)，如果該項(xiàng)為true，表示檢查用戶的其他用戶組屬性。 qmgr -c "set queue SIESTA resources_default.neednodes=siesta" 指定SIESTA隊(duì)列使用的計(jì)算節(jié)點(diǎn)是siesta屬性的(上面1中指定的) 創(chuàng)建完畢后，可以用qmgr -c "p s"查看創(chuàng)建的隊(duì)列情況，如下 # Create and define queue SIESTA # create queue SIESTA set queue SIESTA queue_type = Execution set queue SIESTA resources_default.neednodes = siesta set queue SIESTA acl_group_enable = True set queue SIESTA acl_groups = siesta set queue SIESTA acl_group_sloppy = True set queue SIESTA enabled = True set queue SIESTA started = True 其他的用戶組都可以類比著創(chuàng)建自己的專屬隊(duì)列。 3.啟動(dòng)服務(wù)節(jié)點(diǎn)的pbs_server服務(wù)和maui服務(wù)： qterm -t quick 停止pbs_server服務(wù) pbs_server 重啟pbs_server服務(wù) ps -A |grep maui 找出maui的進(jìn)程號(hào) 18066 ? 00:00:00 maui 殺掉maui進(jìn)程 kill 18066 重新啟動(dòng)maui /usr/local/software/maui-3.3.1/sbin/maui 好了，到此為止，大功告成�？梢允褂昧� 屬于siesta用戶組的用戶提交任務(wù)，就可以默認(rèn)提交到node01-node43上，只要提交滿了，就排隊(duì)，不能提交到node44-node46上。 但是siesta用戶組的成員如果想將自己的某一個(gè)任務(wù)提交到sugon上，而不是powerlead或者dell上，則可以在自己的腳本中寫上： #PBS -l nodes=1:sugon:ppn=8 表示該任務(wù)只向sugon機(jī)器提交，如果sugon滿了，就排隊(duì)，即使powerlead和dell有空閑。 如果寫為#PBS -l nodes=1:dell:ppn=8 那么siesta用戶組的用戶只能提交到node41,42,43這三個(gè)上，如果滿了，就排隊(duì)，直到這三個(gè)節(jié)點(diǎn)有空余。不會(huì)侵占到node44-node46上。 也就是說這兒對(duì)節(jié)點(diǎn)屬性的要求和隊(duì)列本身對(duì)節(jié)點(diǎn)的要求是 “與（and）”的關(guān)系。 如果寫成： #PBS -l nodes=1:ppn=8 那么就會(huì)從node43倒序向node01檢查，看是否有空閑資源。也就是說dell機(jī)器優(yōu)先。 這種做法有一個(gè)不令人滿意的地方：如果other用戶組的用戶用OTHER隊(duì)列向sugon提交任務(wù)的話，那么可以提交，并且不出錯(cuò)，但是任務(wù)始終在排隊(duì)狀態(tài)，永遠(yuǎn)不會(huì)被執(zhí)行。 |
2樓2012-03-14 12:27:31
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