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ter20鐵桿木蟲(chóng) (正式寫手)
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[資源]
通過(guò)電子密度和靜電勢(shì)兩個(gè)cube文件直接在GV中做靜電勢(shì)圖
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看到板上有一篇通過(guò)fchk文件在GV中做靜電勢(shì)圖的文章“分子的靜電勢(shì)的物理意義與圖形表達(dá)”：http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1091031。但是經(jīng)常我們遇到的分子比較大時(shí)，通過(guò)GV產(chǎn)生密度時(shí)速度會(huì)很慢，所以這里我分享一下我的做法。 1. 在服務(wù)器上通過(guò)cubegen命令對(duì)fchk文件操作，產(chǎn)生電子密度和靜電勢(shì)的兩個(gè)cube文件，e.g.， cubegen 0 density test.fchk Density.cube 0 h cubegen 0 potential test.fchk Potential.cube 0 h 2. 用GV打開(kāi)Potential.cube -- Cube Actions -- Load Cube （載入Density.cube）-- Surface Actions -- New Mapped Surface -- 確定即可 不知道有沒(méi)有朋友已經(jīng)發(fā)過(guò)了，這里只是分享一下，希望能夠?qū)Υ蠹矣兴鶐椭? |
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阡陌蔓4樓
2013-04-20 16:12
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Quan.5樓
2013-04-23 06:49
回復(fù)
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