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ououly金蟲 (正式寫手)
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[求助]
關(guān)于遺傳距離問(wèn)題
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| 急求高手指點(diǎn)：我的實(shí)驗(yàn)結(jié)果處理出來(lái)后發(fā)現(xiàn)群體內(nèi)遺傳距離大于群體間遺傳距離，比如A群體內(nèi)個(gè)體間的遺傳距離大于A群體與B群體間的遺傳距離，都是同一個(gè)物種，這是為什么呢？是結(jié)果有誤嗎？ |
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ououly
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2樓2012-03-26 08:42:00
lrrnd
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3樓2012-03-26 09:03:22
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很想知道你用的什么標(biāo)記？種群之間的個(gè)體數(shù)有沒(méi)有差異？遺傳距離大到什么程度？是否采用Fst或是Da等距離進(jìn)行過(guò)比較？ 單純考慮遺傳距離的話，只能說(shuō)明種群內(nèi)存在著很多的稀有單倍型，這要和遺傳多樣性等指標(biāo)結(jié)合起來(lái)看，或者該種群所在地為冰期避難所，其余種群由它擴(kuò)張而得。 |
4樓2012-03-26 17:24:33
可立刻
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| 同一物種不同群體間遺傳距離差異是必然的。在水稻數(shù)據(jù)庫(kù)里不同品種的雜交群體中任意兩個(gè)標(biāo)記間的距離很少有完全相同的，我原來(lái)還遇到很多微小片段顛倒的情況；人類微衛(wèi)星標(biāo)記在的ucsc圖和ncbi上顯示的遺傳距離也是有不小出入。具體原因我不清楚但猜想是群體進(jìn)化不均一造成的，另外群體大小也會(huì)造成作圖的取樣偏差 |
5樓2012-04-17 15:31:19
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