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sinokang至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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[交流]
使用Antechambe處理亞鐵血紅素HEM報(bào)錯(cuò) 已有1人參與
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蛋白中含有亞鐵血紅素HEME，結(jié)構(gòu)如下，使用Antechambe處理時(shí)報(bào)錯(cuò)： Running: /opt/amber10/bin/bondtype -j full -i ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC0 -o ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC -f ac Warning: the assigned bond types may be wrong, please : (1) double check the structure (the connectivity) and/or (2) adjust atom valence penalty parameters in APS.DAT, and/or (3) increase PSCUTOFF in define.h and recompile bondtype.c Be cautious, use a large value of PSCUTOFF (>100) will significantly increase the computation time Error: cannot run "/opt/amber10/bin/bondtype -j full -i ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC0 -o ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC -f ac" in judgebondtype() of antechamber.c properly, exit 請(qǐng)大家指教，謝謝 |
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sinokang
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3樓2012-04-15 18:28:53
2樓2012-04-15 15:09:50
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