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caijj09

木蟲 (職業(yè)作家)

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專業(yè): 無機(jī)納米化學(xué)

[求助] 模擬有機(jī)分子在固體表面吸附出現(xiàn)問題

我在模擬固體表面吸附有機(jī)分子是，出現(xiàn)圖一的錯(cuò)誤，請(qǐng)問大俠怎么解決？

我的操作步驟：

1，建立晶體結(jié)構(gòu)模型，然后優(yōu)化，切表面，分配力場，刪除鍵，固定非表面原子，再M(fèi)inimizer, 然后建真空層（厚度為0），建超胞（2x2x1）；

2，畫好有機(jī)分子，再建一個(gè)空的晶體結(jié)構(gòu)（a, b與第一步中超胞的lattice 一致），利用Amorphous Cell 中的Calculation ——>Packing把有機(jī)分子加到空的晶體結(jié)構(gòu)中；

3，利用Build Layers建第1，第2步的兩個(gè)晶體結(jié)構(gòu)加載到一起。

4，利用Dsicover中的Dynamics 跑動(dòng)力學(xué)。結(jié)果就出現(xiàn)圖一的錯(cuò)誤。

Discover 跑Dynamics出錯(cuò)

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1樓 2012-04-16 10:04:31

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