wpgo

新蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 27.4
散金: 5
帖子: 17
在線: 4.6小時
蟲號: 1653245
注冊: 2012-02-29
專業(yè): 有機合成

[求助] scan文件中想要一個原子向另一個原子運動，怎么設(shè)置

Title Card Required

0 1
Si
Si                1 3.15879818
Si                2 3.10797028 1  138.67849769
O                2 1.59276629 1 11.61338336 3 54.02516532 0 H
O                2 1.63187928 1  120.43538293 4  -51.23813396 0 H
O                1 1.60090032 4  108.95259772 2  157.47624445 0 H
Si                6 1.64247334 1  135.21108082 4  -58.38179073 0 H
Si                3 2.99994609 2  138.58513801 1 29.90711125 0 H
O                3 1.56555724 2  120.30571385 1 30.20886178 0 H
Si                7 5.51486046 6  107.23920721 1  141.47547894 0 H
Si             10 3.14939239 7  103.47414989 6 -100.51064084 0 H
Si             11 3.13982231 10  136.83944773 7 77.54930368 0 H
O                11 1.58355374 10 11.66312461 7 26.18082915 0 H
O                12 1.61648869 11 14.30802637 10 3.03637798 0 H
O                10 1.59642861 7 16.53132092 6 79.96831067 0 H
Si             12 4.45323298 11  167.45925400 10 -121.35340354 0 H
Si             15 1.64029728 10  135.01236007 7 51.88271922 0 H
Si             16 4.56548742 12 68.53460472 11  148.43003252 0 H
Al                8 2.99438591 3  134.01284467 2 39.63206847 0 H
O                18 1.60454284 16 62.32397645 12  -43.68190532 0 H
O                16 1.56652657 12 50.56548195 11  109.90044995 0 H
O                12 1.69577060 11  107.88079595 10  -30.86177774 0 H
O                8 1.59974215 3  110.02727265 2 42.71899167 0 H
O                7 1.60197559 6  101.21883960 1  131.50696233 0 H
C                22 2.57250810 12  139.83268028 11 37.99920772 0 H
C                25 1.52423952 22 34.97298062 12  -66.11698379 0 H
C                26 1.51174116 25  117.54187733 22 -125.58147491 0 H
O                25 1.41132532 22 93.97493245 12 56.92939383 0 H
H                25 1.09716111 22  138.88102613 12  -67.34584995 0 H
H                25 1.09267295 22 94.81545093 12  170.05344248 0 H
H                26 1.07943620 25  105.05935802 22  109.77118276 0 H
H                27 1.09469540 26  107.17132634 25  -55.47714611 0 H
H                27 1.09456939 26  110.95401758 25 -173.62018708 0 H
H                27 1.08867097 26  111.37663202 25 63.72724446 0 H
H                28 0.97219369 25  104.91914644 22 55.67631572 0 H
O                6       3.00231212       1 85.02344109 4 54.91924734 0 H
H                36 0.96618377 6 34.68567850 1 -172.08841255 0 H
H                36 0.96693711 6 82.03379820 1  -41.26106708 0 H
H                3 1.49000000 2  106.74624364 1  154.52938836 0 H
H                3 1.49000000 2  111.70725697 1  -94.47817091 0 H
H                2 1.49000000 1  111.47787282 6  161.98792599 0 H
H                2 1.49000000 1  111.45278295 6 47.06648780 0 H
H                8 1.49000000 3  113.93312442 2  -85.61353112 0 H
H                8 1.49000000 3  106.53485131 2  160.77577023 0 H
H                18 1.49000000 16 86.82766822 12 75.74807496 0 H
H                18 1.49000000 16 77.36196575 12 -177.99842047 0 H
H                18 1.49000000 16  161.67768688 12  -73.50744319 0 H
H                16 1.49000000 12  156.07470270 11  147.76354219 0 H
H                16 1.49000000 12 72.18574473 11 -114.24341872 0 H
H                12 1.49000000 11  106.12782966 10 -155.41022400 0 H
H                12 1.49000000 11  110.66639574 10 97.46363577 0 H
H                11 1.49000000 10  112.93590202 7 -163.04656897 0 H
H                11 1.49000000 10  112.44987197 7  -44.88203194 0 H
H                10 1.49000000 7  126.79727308 6  164.96473573 0 H
H                10 1.49000000 7  119.06096729 6 9.81069880 0 H
H                17 1.49000000 15  115.71214557 10  -10.57160904 0 H
H                17 1.49000000 15 95.82168956 10  101.09833061 0 H
H                7 1.49000000 6  115.33286575 1 12.14630112 0 H
H                7 1.49000000 6 96.29374096 1 -100.10700434 0 H
H                1 1.49000000 6  112.28468507 7 -170.49799745 0 H
H                1 1.49000000 6  123.57725479 7 53.53903694 0 H
H                16 1.49000000 12 91.55021941 11 -4.27194665 0 H

想讓36號原子朝26號原子運動去scan（就是黑體的那兩個原子），怎么設(shè)置呀

[ Last edited by wpgo on 2012-4-16 at 13:36 ]

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

細胞培養(yǎng)，這22個細節(jié)一定要注意�。ㄒ唬� 已經(jīng)有0人回復(fù)
CSC訪學(xué)博后項目獲批，外方學(xué)校暫停合作該怎么辦？已經(jīng)有51人回復(fù)
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費? 已經(jīng)有140人回復(fù)
大灣區(qū)大學(xué)劉天輝課題組招收2026級博士生（與中山大學(xué)物理學(xué)院聯(lián)合培養(yǎng)）已經(jīng)有22人回復(fù)
PbS量子點紫外吸收已經(jīng)有0人回復(fù)
比利時魯汶大學(xué)與國家留學(xué)基金委共同資助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship 已經(jīng)有0人回復(fù)
七嗪類物質(zhì)合成求助已經(jīng)有0人回復(fù)
倫敦大學(xué)學(xué)院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光譜、催化相關(guān)26年博士生已經(jīng)有11人回復(fù)
分子動力學(xué)模擬合作需求已經(jīng)有2人回復(fù)
中國科學(xué)院成都山地災(zāi)害與環(huán)境研究所2026年特別研究助理（博士后）招聘啟事已經(jīng)有0人回復(fù)

» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:

搞一個20個原子左右的計算，需要什么配置的電腦？已經(jīng)有12人回復(fù)
如何把cif文件中有統(tǒng)計的占有率不是1的原子在畫圖時變?yōu)橐粋€原子已經(jīng)有6人回復(fù)
高斯view中調(diào)節(jié)鍵長時怎么使四五個原子組成一個團（group）,和另一個原子之間進行調(diào)節(jié) 已經(jīng)有4人回復(fù)
【求助】如何在siesta中設(shè)置ghost state原子的計算已經(jīng)有16人回復(fù)
【求助】建立只含一個原子的晶包做計算總是出錯？已經(jīng)有11人回復(fù)
【求助】在結(jié)構(gòu)中想讓N原子帶一個電荷該怎么設(shè)置？已經(jīng)有4人回復(fù)
【求助】Ms計算磁性要不要設(shè)置每個原子的磁矩？？已經(jīng)有10人回復(fù)
【求助】如何計算一個原子的能量已經(jīng)有10人回復(fù)
【求助】如何判斷一個原子在原包內(nèi)部已經(jīng)有4人回復(fù)
【求助】關(guān)于晶胞中取代一個原子的優(yōu)化問題已經(jīng)有14人回復(fù)

1樓 2012-04-16 13:33:42

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

dragon0714

鐵蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 52
帖子: 16
在線: 13.1小時
蟲號: 1434359
注冊: 2011-10-09
性別: GG
專業(yè): 配位化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

不太明白lz什么意思，是否可以直接修改坐標？

贊一下

回復(fù)此樓

無往不勝

2樓2012-04-16 16:17:43

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

ldzh0531

木蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 46 (小學(xué)生)
金幣: 2014
散金: 5
紅花: 3
帖子: 277
在線: 33.1小時
蟲號: 1130043
注冊: 2010-10-23
專業(yè): 理論和計算化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

只是原子動還是原子所在的集團一起動？gaussview可以指定scan的。

贊一下

回復(fù)此樓

3樓2012-04-16 23:50:27

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

beefly

專家顧問 (職業(yè)作家)

地溝油冶煉專家

專家經(jīng)驗: +458
QC強帖: 12
應(yīng)助: 88 (初中生)
金幣: 13022.2
散金: 27307
紅花: 300
帖子: 4673
在線: 927.1小時
蟲號: 408372
注冊: 2007-06-21
性別: GG
專業(yè): 理論和計算化學(xué)
管轄: 計算模擬

使用z矩陣坐標，其中兩個原子距離定義為參數(shù)。

贊一下

回復(fù)此樓

beefly《西太平洋大學(xué)現(xiàn)代英漢詞典》[bi:fli]牛肉一般地

4樓2012-04-17 00:13:00

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lishijunzong

鐵桿木蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 214 (大學(xué)生)
金幣: 5034
紅花: 10
帖子: 574
在線: 195.1小時
蟲號: 1121020
注冊: 2010-10-13
性別: GG
專業(yè): 理論和計算化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

先把原子序號給改下，寫成內(nèi)坐標的形式。然后scan兩原子距離即可

贊一下

回復(fù)此樓

5樓2012-04-17 18:34:50

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

雪比亞麻布

銀蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 279.5
帖子: 8
在線: 7.4小時
蟲號: 1173662
注冊: 2010-12-20
性別: MM
專業(yè): 數(shù)學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

找到要走的那個原子，在B(bond)后面寫參數(shù)，例如0.05 10 就代表走10步每步0.05，相當(dāng)于A到B的距離。

贊一下

回復(fù)此樓

6樓2012-04-25 16:40:28

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]	作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 356求調(diào)劑 +3	gysy?s?a 2026-03-28	3/150	2026-03-29 00:33 by 544594351
[考研] 0856求調(diào)劑 +6	楒桉 2026-03-28	6/300	2026-03-29 00:31 by 544594351
[考研] 2026年華南師范大學(xué)歡迎化學(xué)，化工，生物，生醫(yī)工等專業(yè)優(yōu)秀學(xué)子加入！ +3	llss0711 2026-03-28	5/250	2026-03-29 00:23 by MRMFYTL
[考研] 304求調(diào)劑 +6	曼殊2266 2026-03-27	6/300	2026-03-28 14:10 by 唐沐兒
[考研] 070300求調(diào)劑306分 +4	26要上岸 2026-03-27	4/200	2026-03-28 13:06 by 唐沐兒
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +7	hanamiko 2026-03-27	7/350	2026-03-28 09:56 by 李上岸0921
[考研] 材料與化工考研調(diào)劑 +17	孅華 2026-03-22	17/850	2026-03-28 08:35 by WYUMater
[考研] 311求調(diào)劑 +3	希望上岸阿小楊 2026-03-23	3/150	2026-03-28 07:57 by 熱情沙漠
[考研] 265求調(diào)劑11408 +3	劉小鹿lu 2026-03-27	3/150	2026-03-27 20:53 by nihaoar
[考研] 一志愿南師大0703化學(xué) 275求調(diào)劑 +4	Ripcord上岸 2026-03-27	4/200	2026-03-27 17:00 by zhyzzh
[考研] 一志愿北京化工大學(xué) 070300 學(xué)碩 336分求調(diào)劑 +9	vv迷 2026-03-22	9/450	2026-03-27 15:59 by 不吃魚的貓
[考研] 安徽大學(xué)專碩生物與醫(yī)藥專業(yè)(086000)324分，英語已過四六級，六級521，求調(diào)劑 +4	美味可樂雞翅 2026-03-26	4/200	2026-03-27 15:27 by 星空星月
[考研] 考研化學(xué)308分求調(diào)劑 +10	你好明天你好 2026-03-23	12/600	2026-03-27 14:43 by shangxh
[考研] 化學(xué)308分求調(diào)劑 +8	你好明天你好 2026-03-23	9/450	2026-03-27 14:01 by 楊光于青云
[考研] 085601 材料工程 313分求調(diào)劑 +5	Ong3 2026-03-27	5/250	2026-03-27 12:24 by goldfish51
[考研] 336材料求調(diào)劑 +7	陳瀅瑩 2026-03-26	9/450	2026-03-27 00:20 by wxiongid
[考研] 334分一志愿武理材料求調(diào)劑 +4	李李不服輸 2026-03-26	4/200	2026-03-26 16:00 by 不吃魚的貓
[考研] 材料科學(xué)與工程 317求調(diào)劑 +4	JKSOIID 2026-03-26	4/200	2026-03-26 15:58 by 不吃魚的貓
[考研] 340求調(diào)劑 +5	話梅糖111 2026-03-24	5/250	2026-03-25 06:53 by ilovexiaobin
[考研] 求老師收我 +3	zzh16938784 2026-03-23	3/150	2026-03-23 12:56 by ztnimte