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baihe869金蟲 (小有名氣)
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[求助]
Linux遠程操作chk文件無法轉(zhuǎn)換
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我最近用SSH遠程操作，在集群上用Gaussian 09計算得到的chk文件，在轉(zhuǎn)換成fchk文件時總出錯。 注：計算是正常結(jié)束的，重新算了還是這樣，現(xiàn)在已經(jīng)證實chk文件沒有問題。請各位幫我分析一下到底是什么原因？ 我在windows下遠程操作linux系統(tǒng)輸入的命令是：formchk *.chk 然后就出現(xiàn)了一下編碼： smj@gomberg00:~$ formchk HBC.chk Read checkpoint file HBC.chk Write formatted file HBC.fchk Operation on file out of range. FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len= 44100 IPos= 0 Q= 13504352 dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles = 47 SizExt = 32768 WInBlk = 512 defal = F LstWrd = 2490368 FType=2 FMxFil=10000 Number 0 0 0 0 0 0 0 0 Base 1226088 2270286 237438 1325575 1244530 568981 1891640 2384653 End 1226090 2286749 243230 1455904 1324053 826632 2092796 2490368 End1 1226090 2286749 243230 1455904 1324053 826632 2092796 2490368 Wr Pntr 1226088 2270286 237438 1325575 1244530 568981 1891640 2384653 Rd Pntr 1226088 2270286 237438 1325575 1244530 568981 1891640 2384653 Length 2 16463 5792 130329 79523 257651 201156 105715 Number 501 502 503 508 511 520 521 522 Base 439036 440036 1324794 40960 448542 568905 826632 41190 End 440036 444804 1325215 40990 534864 568915 826667 42074 End1 440036 444804 1325215 40990 534864 568915 826667 42074 Wr Pntr 439036 440036 1324794 40960 448542 568905 826632 41190 Rd Pntr 439036 440036 1324794 40960 448542 568905 826632 41190 Length 1000 4768 421 30 86322 10 35 884 Number 524 526 536 538 545 548 551 552 Base 826667 1022031 243230 341133 1242443 42074 568943 568915 End 1022031 1217395 341133 439036 1242471 237438 568981 568943 End1 1022031 1217395 341133 439036 1242471 237438 568981 568943 Wr Pntr 826667 1022031 243230 341133 1242443 42074 568943 568915 Rd Pntr 826667 1022031 243230 341133 1242443 42074 568943 568915 Length 195364 195364 97903 97903 28 195364 38 28 Number 561 562 569 575 584 585 603 605 Base 562196 562197 1242441 2092796 538594 1226151 2286749 1226090 End 562197 568905 1242443 2270286 538954 1242441 2384653 1226151 End1 562197 568905 1242443 2270286 538954 1242441 2384653 1226151 Wr Pntr 562196 562197 1242441 2092796 538594 1226151 2286749 1226090 Rd Pntr 562196 562197 1242441 2092796 538594 1226151 2286749 1226090 Length 1 6708 2 177490 360 16290 97904 61 Number 607 619 665 670 672 674 694 695 Base 1243204 1217395 534864 444804 1324053 1324222 1243646 538954 End 1243646 1226088 538594 448542 1324222 1324794 1244530 540842 End1 1243646 1226088 538594 448542 1324222 1324794 1244530 540842 Wr Pntr 1243204 1217395 534864 444804 1324053 1324222 1243646 538954 Rd Pntr 1243204 1217395 534864 444804 1324053 1324222 1243646 538954 Length 442 8693 3730 3738 169 572 884 1888 Number 698 701 773 989 993 997 998 Base 1325215 1242471 1455904 540842 560842 561042 40990 End 1325575 1243204 1891640 560842 561042 562196 41190 End1 1325575 1243204 1891640 560842 561042 562196 41190 Wr Pntr 1325215 1242471 1455904 540842 560842 561042 40990 Rd Pntr 1325215 1242471 1455904 540842 560842 561042 41090 Length 360 733 435736 20000 200 1154 200 Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO. Segmentation fault |
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冬天里的驕陽
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【答案】應(yīng)助回帖
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gmy1990: 金幣+3 2012-04-25 19:20:46
baihe869: 金幣+5, ★★★很有幫助, thanks 2012-04-27 23:25:08
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假如你的用戶名為user，g09安裝在user下，則 /home/user/g09/formchk HBC.chk HBC.fch 如果仍不行，考慮加大內(nèi)存 在環(huán)境變量中加入 export GAUSS_MEMDEF=2000000000（數(shù)字依情況而定） 再執(zhí)行。 |
3樓2012-04-25 18:39:44
zhangji3013
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2樓2012-04-25 17:19:19
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