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銀蟲 (初入文壇)

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[求助] Gaussview作圖出來的給Gaussian的input file的格式問題，小白求幫助~~

只是想問這個(gè)內(nèi)坐標(biāo)之后的一堆從1到22的參數(shù)是什么啊。。。

%chk=D:\Drivers\Group2\Gaussview files\q2-2.chk
# opt=modredundant b3lyp/3-21g* geom=connectivity

q2

0 1
C
H                1 1.07000000
C                1 1.54000000 2  138.16968601
H                3 1.07000000 1  109.47122105 2  -95.02968017 0
H                3 1.07000000 1  109.47122073 2 24.97031993 0
H                3 1.07000000 1  109.47122075 2  144.97031962 0
C                1 1.54000000 3 87.15864072 4 -172.56588855 0
O                7 1.25840000 1  120.00000021 3  -18.67259321 0
N                7 1.47000000 1  119.99999999 3  161.32740580 0
H                9 1.00000001 7  109.47122065 1  -29.99999921 0
C                9 1.46999999 7  109.47122085 1 -149.99999959 0
H                11 1.07000001 9  109.47122075 7 -180.00000000 0
H                11 1.07000000 9  109.47122061 7  -60.00000001 0
H                11 1.07000000 9  109.47122091 7 60.00000025 0
N                1 1.47000000 3 82.31301271 7  140.16145694 0
H                15 1.00000000 1  109.47122063 3 -173.14427045 0
C                15 1.47000000 1  109.47122059 3 66.85572989 0
O                17 1.25840000 15  119.99999994 1 -150.00000023 0
H                17 1.84604170 15  104.18119024 1 -4.42125601 0
C                17 1.54000000 15  119.99999994 1 29.99999984 0
H                20 1.07000000 17  120.15844937 15 -156.18696682 0
H                20 1.07000000 17  119.60459788 15 17.27970348 0

1 2 1.0 3 1.0 7 1.0 15 1.0
2
3 4 1.0 5 1.0 6 1.0
4
5
6
7 8 2.0 9 1.0
8
9 10 1.0 11 1.0
10
11 12 1.0 13 1.0 14 1.0
12
13
14
15 16 1.0 17 1.0
16
17 18 2.0 20 1.0
18
19 20 1.0
20 21 1.0 22 1.0
21
22

D 3 1 15 16 S 2 30.000000

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1樓 2012-04-29 00:46:08

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superrice

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zhou2009: 金幣+3 2012-04-29 08:30:17
fd_wonder: 金幣+2, 非常感謝~ 2012-04-29 10:31:24

geom=connectivity
在結(jié)構(gòu)說明及其修改部分之后，通過附加的輸入部分（需要空行終止）
直接指定原子成鍵數(shù)據(jù)。該選項(xiàng)對(duì)每個(gè)輸入的原子需要一行，順序和原
子說明部分相同，語法為：
N1 Order1 [N2 Order2...]
其中的各個(gè)N 是和當(dāng)前原子成鍵的原子，Order 是成鍵的鍵級(jí)。例如，這
個(gè)例子指定當(dāng)前原子與原子4 和5 成鍵，鍵級(jí)分別為1.0 和2.0：
4 1.0 5 2.0

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2樓2012-04-29 07:45:19

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superrice

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引用回帖:

2樓: Originally posted by superrice at 2012-04-29 07:45:19:
geom=connectivity
在結(jié)構(gòu)說明及其修改部分之后，通過附加的輸入部分（需要空行終止）
直接指定原子成鍵數(shù)據(jù)。該選項(xiàng)對(duì)每個(gè)輸入的原子需要一行，順序和原
子說明部分相同，語法為：
N1 Order1
其中的各個(gè)N ...

選自高斯03的說明書

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3樓2012-04-29 07:45:35

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070241078

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

計(jì)算時(shí)，內(nèi)坐標(biāo)下邊1到22的參數(shù)都可以刪掉的

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4樓2012-04-29 09:05:59

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一起來化學(xué)

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

下面的確實(shí)可以刪掉。。。。。。

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大家多多交流

5樓2012-04-29 09:31:37

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引用回帖:

4樓: Originally posted by 070241078 at 2012-04-29 09:05:59:
計(jì)算時(shí)，內(nèi)坐標(biāo)下邊1到22的參數(shù)都可以刪掉的

非常感謝~
還想問我想算兩個(gè)二面角轉(zhuǎn)動(dòng)過程中形成的二維勢(shì)能面，算到一半會(huì)報(bào)錯(cuò)，“The processing of the last link ended abnormally.”是啥原因呀。。我的input file如下：

%chk=D:\Drivers\Group2\Gaussview files\q2-2.chk
# opt=modredundant b3lyp/3-21g popt=maxcyc=300

q2

0 1
C                0.00000000 0.00000000 0.00000000
H                0.00000000 0.00000000 1.07000000
C                1.02706726 0.00000000 -1.14748980
H                1.19903630 1.00492118 -1.47223596
H                1.94635986 -0.42586603 -0.80333976
H                0.64941730 -0.57905516 -1.96417556
C                0.29826226 -1.50185756 0.16450988
O                0.84575512 -2.14080399 -0.77120887
N                -0.05658664 -2.18906357 1.41460194
H                -0.00919344 -1.54212073 2.17566624
C                0.88448081 -3.29335924 1.65087104
H                0.62618944 -3.79357043 2.56080200
H                0.83377008 -3.98558808 0.83653225
H                1.87847759 -2.90472631 1.72725707
N                0.63025370 1.29365588 0.30022448
H                0.27185597 1.64644200 1.16456991
C                0.33216821 2.24614348 -0.77904028
O                1.15135025 3.16059228 -1.05525530
H                -0.58504003 1.24232177 -2.02761586
C                -0.98260733 2.12490693 -1.57167322
H                -1.05375520 2.52898262 -2.55988414
H                -1.78861877 1.54498669 -1.17300284

D 3 1 7 8 S 36 10.000000
D 16 15 1 3 S 36 10.000000

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6樓2012-04-29 10:46:22

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呃，是坐標(biāo)用得不對(duì)的原因嗎？

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7樓2012-04-29 10:50:36

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