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Illusionist銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
如何做vasp摻雜
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本人想用vasp做摻雜計(jì)算，剛開(kāi)始學(xué) 1.直接建立3x3x3的超晶格模型 1）關(guān)于K的選擇 3x3x3 -1019.397709 4x4x4 -1019.397873 所以選擇了3x3x3 2）ENCUT 280 4093.144030 300 4093.144030 320 4093.144030 340 4093.144030 這里我最后選擇了500ENCUT去進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化。 2.結(jié)構(gòu)優(yōu)化INCAR： SYSTEM=SnO2 ENCUT=500 ISMEAR=-5 GGA=91 VOSKOWN=1 ISYM=0 ISIF=3 NSW=100 PTIOM=0.1 IBRION=2 這里我選擇打破對(duì)稱性不知道是否合理 ISYM=0設(shè)置前后影響挺大，起碼晶格常數(shù)會(huì)變化。LREAL=auto設(shè)置后，晶格常數(shù)也會(huì)有明顯變化，請(qǐng)問(wèn)一下一般如何處理這樣的問(wèn)題 另外我想在這一步結(jié)束后摻入替位的Sb，但是Sb有+3和+5價(jià)之分，該如何設(shè)定價(jià)態(tài)呢 |
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7樓2012-05-14 20:57:00
賀儀
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首先對(duì)你的數(shù)據(jù)： 2）ENCUT 280 4093.144030 300 4093.144030 320 4093.144030 340 4093.144030 表示懷疑 其次對(duì)稱性沒(méi)必要打破，設(shè)置isif=3就可以了 |
5樓2012-05-14 14:32:59
dxf_dxf_dxf
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先在1x1x1體系下用ISIF=7優(yōu)化得到粗略的晶格常數(shù) 然后做ENCUT和KPOINTS的收斂性測(cè)試 按滿足收斂條件的ENCUT和KPOINTS值，計(jì)算不同晶格常數(shù)下體系的能量 用murn.f擬合得到平衡態(tài)晶格常數(shù)。 把1x1x1體系按比例放大，得到2x2x2/3x3x3/4x4x4等體系。 對(duì)3x3x3體系： KPOINTS設(shè)成 然后進(jìn)行ENCUT收斂性測(cè)試，記錄不同ENCUT情況下能量和cpu time 然后在4x4x4x體系下做同樣的事情，記錄不同ENCUT情況下能量和cpu time 再重復(fù)至5x5x5,6x6x6,7x7x7 計(jì)算時(shí)間超過(guò)48小時(shí)的任務(wù)就可以忽略了。 綜合考慮性能和精度的影響，確定最后選用的摻雜體系，例如我就選用4x4x4體系。 在此體系下，加入摻雜原子，按照之前收斂性測(cè)試的結(jié)果設(shè)置ENCUT 接下來(lái)就開(kāi)始幾何優(yōu)化了。這里一般要求保持原胞的形狀和體積，不過(guò)你也可以先優(yōu)化原胞的體積，一般不要優(yōu)化原胞的形狀。不過(guò)這也說(shuō)不定，例如極高壓情況中體系的晶格會(huì)改變(例如從體心立方變成六角密堆，所以原胞形狀是否改變跟你所做的具體工作有關(guān)。) 優(yōu)化好原胞以后再做離子遲豫。你可以自己寫(xiě)腳本計(jì)算，也可以讓vasp自己算。 |
12樓2012-05-17 13:44:14
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首先打破對(duì)稱性是可以的，只不過(guò)計(jì)算可能會(huì)多費(fèi)點(diǎn)時(shí)間； 至于替位摻雜，要考慮一下?lián)诫s原子與被摻雜原子是否是等價(jià)的，若果是非等價(jià)摻雜要考慮電荷補(bǔ)償?shù)膯?wèn)題，相關(guān)參數(shù)是NELECT,具體關(guān)于這方面之前本版有很多的相關(guān)帖子可以參考，自己搜一下。 |
2樓2012-05-14 14:13:29
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4樓2012-05-14 14:25:10
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Illusionist: 金幣+20, ★★★很有幫助, Gamma計(jì)算什么，結(jié)構(gòu)優(yōu)化還是收斂測(cè)試？對(duì)于K空間的gamma點(diǎn)對(duì)應(yīng)的應(yīng)該是是空間的晶格邊界還是中心，摻雜的時(shí)候最好不要放在邊間還是中心？ 2012-05-17 08:48:09
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摻雜的問(wèn)題，建議把K格點(diǎn)設(shè)成只有Gamma點(diǎn)，再用更大的晶格(例如4x4x4,5x5x5,6x6x6等)。 至于收斂性測(cè)試，要注意收斂條件是 ，而不是 在優(yōu)化幾何結(jié)構(gòu)的時(shí)候，建議不要使用ISIF=3選項(xiàng)！速度會(huì)非常慢。在同樣的計(jì)算條件下，建議用loop.sh方案。 一般來(lái)說(shuō)，先在1x1x1體系下在實(shí)驗(yàn)測(cè)得的晶格常數(shù)基礎(chǔ)上用ISIF=7優(yōu)化得到體系的晶格常數(shù)。 然后作等比例放大，得到nxnxn體系的POSCAR，然后用循環(huán)靜態(tài)計(jì)算這個(gè)晶格常數(shù)附近幾個(gè)值對(duì)應(yīng)的體系的能量，用murn方程擬合得到體系的平衡態(tài)晶格常數(shù)。 |
9樓2012-05-17 00:07:44
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10樓2012-05-17 00:09:49
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