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lan徉yang鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
求一個WIEN2k服務器計算的Pbs提交命令文件
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| 我想問的是，是不是不同服務器用的pbs文件都不一樣呢？哪位大俠有的話，給一個，謝謝 |
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liuxiaocunde
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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3樓2012-06-08 09:29:35
bjwang
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【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數(shù) +1
賀儀: 金幣+1, 謝謝交流 2012-05-16 20:00:13
感謝參與，應助指數(shù) +1
賀儀: 金幣+1, 謝謝交流 2012-05-16 20:00:13
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我也正在找提交的腳本，我的是sge，官網(wǎng)上有類似的，不知道如何改。 http://www.wien2k.at/reg_user/faq/pbs.html |
2樓2012-05-16 15:25:51
yh3166
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【答案】應助回帖
★ ★ ★
fzx2008: 金幣+3, 謝謝分享 2012-06-12 20:17:03
fzx2008: 金幣+3, 謝謝分享 2012-06-12 20:17:03
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#!/bin/sh #PBS -N #文件名稱 #PBS -d ./ #PBS -o ./ #PBS -e ./ #PBS -l nodes=2:ppn=8 #這個不解釋了吧 #PBS -l walltime=240:00:00 #PBS -l mem= #PBS -q paraque #并行 還有串行，胖節(jié)點 自己搜搜 #PBS -V source /opt/intel/impi/3.1/bin64/mpivars.sh source /opt/intel/cce/10.1.021/bin/iccvars.sh source /opt/intel/fce/10.1.021/bin/ifortvars.sh source /opt/intel/mkl/10.1.2.024/tools/environment/mklvarsem64t.sh ## wien2k env ################################################################# curdir=`pwd` # added by WIEN2k: BEGIN # -------------------------------------------------------- alias lsi="ls -aslp *.in*" alias lso="ls -aslp *.ou*" alias lsd="ls -aslp *.def" alias lsc="ls -aslp *.cl*" alias lss="ls -aslp *.sc*" alias lse="ls -aslp *.error" alias pslapw="ps -ef |grep "lapw"" alias cdw="cd $curdir" export OMP_NUM_THREADS=1 #export LD_LIBRARY_PATH=..... export EDITOR="xterm -e vi" export SCRATCH=$curdir export WIENROOT=/opt/issp2/wien2k #這個你可以改改目錄，不同版本 export W2WEB_CASE_BASEDIR=$curdir export STRUCTEDIT_PATH=$WIENROOT/SRC_structeditor/bin export PDFREADER=acroread export PATH=$PATH:$WIENROOT:$STRUCTEDIT_PATH:. export OCTAVE_EXEC_PATH=${PATH}:: export OCTAVE_PATH=${STRUCTEDIT_PATH}:: export PATH=$PATH:$WIENROOT:. ulimit -s unlimited alias octave="octave -p $OCTAVE_PATH" # -------------------------------------------------------- # added by WIEN2k: END EXEC="runsp_lapw -ec 0.00001 -cc 0.0001 -i 10 -p" #命令，最重要的 cat $PBS_NODEFILE > nodelist.$$ sed -i s/$/-ib/ nodelist.$$ echo "###################" > .machines echo "granularity:1" >> .machines echo "lapw0:"`sed -n 1p nodelist.$$` >> .machines for i in `cat nodelist.$$` do echo "1:"$i":1" >> .machines done echo "extrafine:1" >> .machines rm -f nodelist.$$ $EXEC |
4樓2012-06-12 19:52:12
楊尋
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上面那個腳本挺好。。 5樓2012-11-02 14:44:00
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