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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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pengkai

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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[交流] 求助一個(gè)DNA片段的構(gòu)型優(yōu)化用什么軟件好已有1人參與

最近在購(gòu)買了34個(gè)堿基的合成DNA序列，分子量大概10000，已經(jīng)通過(guò)繪制軟件畫(huà)出了分子式。由于想知道該DNA的立體結(jié)構(gòu)，所以需要對(duì)其進(jìn)行優(yōu)化。不知道哪個(gè)軟件可以執(zhí)行這個(gè)功能。曾經(jīng)考慮用MS，但是原子數(shù)太多，很難進(jìn)行計(jì)算。請(qǐng)有經(jīng)驗(yàn)的大俠幫助一下小蟲(chóng)。在此謝過(guò)。

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1樓 2012-05-16 11:45:36

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pengkai

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2樓: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-16 13:58:36:
你既然知道了堿基序列，用NAMD 模擬，VMD顯示

簡(jiǎn)單看了一下NAMD，請(qǐng)問(wèn)該軟件是否能在XP下運(yùn)行？需要自己編寫(xiě)代碼嗎？

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3樓2012-05-16 20:02:33

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chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-05-16 15:47:20

你既然知道了堿基序列，用NAMD 模擬，VMD顯示

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2樓2012-05-16 13:58:36

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3樓: Originally posted by pengkai at 2012-05-16 20:02:33:
簡(jiǎn)單看了一下NAMD，請(qǐng)問(wèn)該軟件是否能在XP下運(yùn)行？需要自己編寫(xiě)代碼嗎？

可以在XP下運(yùn)行，要是計(jì)算體系比較大，最好還是LINUX下并行計(jì)算
你可以到NAMD的官方網(wǎng)站去看看吧

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4樓2012-05-16 20:07:26

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