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ellemiu鐵桿木蟲(chóng) (正式寫手)
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[求助]
IRC 結(jié)果分析
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TS尋找過(guò)渡態(tài)，完了以后用IRC掃描勢(shì)能面，順利收斂，，在分析結(jié)果的時(shí)候卻意外的發(fā)現(xiàn)，irc的勢(shì)能面掃描過(guò)程中，開(kāi)始點(diǎn)和結(jié)束點(diǎn)的幾何構(gòu)型幾乎一樣，反應(yīng)產(chǎn)物，感覺(jué)只是鍵在來(lái)回震蕩。 好吧，問(wèn)題出來(lái)了 1、這樣的結(jié)果說(shuō)明什么？ 如果這是一個(gè)正常的結(jié)果，是不是意味著我的反應(yīng)不能發(fā)生 2、如果不是正常的結(jié)果，，改如何避免這樣的情況呢？ 拜請(qǐng)各位大神不吝賜教。 本人計(jì)算的是一個(gè)是H原子的遷移過(guò)程，涉及自由基。 IRC輸入文件如下： %chk=h3tsirc2.chk %nprocshared=4 %mem=4GB # b3lyp/6-31g scfcyc=300 irc=(calcfc,maxpoints=20) TS-Ph-H-OC-Ph 0 2 第一張，irc掃描完以后的結(jié)果 irc掃描完以后的結(jié)果 |
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 過(guò)渡態(tài) |
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11樓2012-05-22 11:34:20
meteoric30
木蟲(chóng) (正式寫手)
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2樓2012-05-18 15:35:18
ellemiu
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫手)
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3樓2012-05-18 16:20:22
4樓2012-05-18 17:58:22
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+2 2012-05-19 08:59:34
ellemiu: 金幣+4, ★★★很有幫助, 分子體系是比較小，我先按照你給的建議來(lái)試試。對(duì)于IOP的設(shè)定，我一直弄的不是很懂，能否做一下解釋？ 2012-05-21 10:21:57
ellemiu: 金幣+4, ★★★很有幫助, 樓主很熱心，追加金幣 2012-05-22 14:46:41
ellemiu: 金幣+5, ★★★很有幫助, 很熱心的網(wǎng)友。 2012-05-26 10:21:29
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| 按照你的說(shuō)法，這個(gè)IRC應(yīng)該不是一個(gè)正確的IRC，不過(guò)這不代表你的TS就不對(duì)。我覺(jué)得可以嘗試 去掉scfcyc=300，因?yàn)閺哪芰可峡�，你的分子不是很大，小分子迭代次�?shù)過(guò)多，容易結(jié)構(gòu)不合理，也就是可能跑偏了，改用iop（5/13=1）。還有就是可以嘗試減小步長(zhǎng)（stepsize=10是default）。 |
5樓2012-05-19 06:55:35
ellemiu
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6樓2012-05-21 10:15:58
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7樓2012-05-21 10:22:17
ellemiu
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8樓2012-05-21 10:22:21
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iop（5/13=1）的意思忽略不收斂的failure，繼續(xù)算下去。 高斯官網(wǎng)有個(gè)IOp reference， http://www.gaussian.com/g_tech/g_iops/iops_toc.htm 大部分IOp的意思可以在里面查到，但是還是不全。Sobereva大神有幾個(gè)帖子專門介紹IOp的，感興趣的可以搜一下看看。 一般情況下，判斷TS是否合理，可以看虛頻，如果虛頻的指向是你所需要的成鍵和斷鍵的方向，一般情況可以初步判斷合理，但是還是需要通過(guò)IRC才算是比較準(zhǔn)確了。 |
9樓2012-05-22 08:35:41
ellemiu
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10樓2012-05-22 08:46:16
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