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xxwn銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
本人使用Schrödinger的prime模塊中GBSA進(jìn)行能量分析，求達(dá)人分析結(jié)果
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分子動(dòng)力學(xué)進(jìn)行完畢后，本想在AMBER中進(jìn)行mm/PBSA計(jì)算，但是時(shí)間較緊迫，故使用了Schrödinger中的GBSA，其中一個(gè)分析結(jié)果如下（任意一幀結(jié)果，共1000幀）但是初次使用，結(jié)果并不會(huì)分析，求解答，最好能解釋各個(gè)能量之間換算的關(guān)系，以及對(duì)復(fù)合物的影響，謝謝！ r_psp_Prime_Energy_Difference -42.13 r_psp_Prime_Coulomb -4570.599034 r_psp_Prime_Covalent 19031.46449 r_psp_Prime_vdW -211.032112 r_psp_Prime_Solv_SA 10.183243 r_psp_Prime_Solv_GB -987.965044 r_psp_Prime_Energy 13272.05154 r_psp_Prime_MMGBSA_Complex_Energy 13272.05154 r_psp_Prime_MMGBSA_Ligand_Energy -37.86542343 r_psp_Prime_MMGBSA_Receptor_Energy 13335.94318 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind -26.0262129 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Coulomb -7.305446 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Covalent 3.097083 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_vdW -44.130689 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Solv_SA 2.568801 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Solv_GB 19.744038 |
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4樓2018-04-10 00:04:47
xxwn
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3樓2018-04-09 11:23:40
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