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用TOPOS分析拓撲時三連接配體的如何設(shè)置為中心原子
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4樓2012-05-28 08:15:19
樂此不疲
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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huangjr: 金幣+1, 感謝應(yīng)助~ 2012-05-23 12:30:51
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首先做AutoCN 用算檢查你所要的原子的配位數(shù)（圖1中的 CN ）是否是你要的 再雙擊化合物名字，跳出Crystal data 窗口 選擇Adjacency Matrix(如圖二) 在這個窗口中點擊中心原子前面的的加號，下面顯示的就是軟件計算的與你原子配位的原子，檢查好。如果有原子沒與中心原子參與配位，那么把它選中，右擊鼠標，在change type里選擇No Bond。（建議把氫原子刪除）改好之后然后點保存。 這個時候你回去做ADS計算，這個中心原子的簡化就是對的。 1 2 3 |
2樓2012-05-22 23:00:24
樂此不疲
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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lyl163com: 金幣+20, ★★★★★最佳答案 2012-05-25 18:33:49
lyl163com: 金幣+20, ★★★★★最佳答案 2012-05-25 18:33:49
| 先用shelx軟件在配體中間插入原子，與其他原子相連，刪除多余原子。保存，做一次XL運算。這個時候的CIF文件就是簡化后的配體了，具體看看給你傳的這個附件。 |
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2012-05-22 23:09:02, 992.98 K
3樓2012-05-22 23:12:00
ys851216
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5樓2012-05-28 08:58:50
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