xiaohuiyi

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[交流] A類(lèi)錯(cuò)誤.A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure 已有6人參與

晶系是，MONOCLICNIC
z=4
解完之后R=0.057 goof=1.07
checkcif的時(shí)候出現(xiàn)A類(lèi)錯(cuò)誤，A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure
我有兩個(gè)疑問(wèn)，不知道各位同學(xué)和老師有遇到過(guò)沒(méi)
1.Squeez之后有個(gè)信息表
voids的體積945.9立方埃，可是我的晶格常數(shù)是a 14.089(5) b 16.306(5) c 16.915(5)，這個(gè)空洞是不是太大了？
2就是這cif模擬出的XRD怎么和粉末不一樣？粉末就是這個(gè)晶體研磨出來(lái)的。。。

先謝謝大家了

[ Last edited by xiaohuiyi on 2012-5-28 at 17:33 ]

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1樓 2012-05-28 16:31:40

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cfocus20

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linhua0402313: 金幣+1, 歡迎回帖交流，辛苦了 2012-05-30 09:02:43
linhua0402313: 專(zhuān)家考核 2012-05-30 09:03:04

Q1: 必須將xxx.sqz檔案內(nèi)容copy至xxx.cif檔案在最後面, 這樣進(jìn)行cif check就不會(huì)出現(xiàn)上述這個(gè)問(wèn)題了!

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2樓2012-05-29 02:08:58

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xiaochong98

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linhua0402313: , 感謝回帖交流，很專(zhuān)業(yè)啊，能不能詳細(xì)點(diǎn) 2012-05-30 09:03:56

粉末與單晶模擬不一樣，考察一下，是否存在壓力轉(zhuǎn)晶，在研磨時(shí)溶劑揮發(fā)了。

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北京人

3樓2012-05-29 07:59:51

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jkyuan

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linhua0402313: , 亂碼，請(qǐng)重新編輯，謝謝 2012-05-30 09:04:36

還有??些溶劑分??沒(méi)有定??。建議盡??????使用squeeze命令

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4樓2012-05-30 08:14:55

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尚云鳳

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引用回帖:

2樓: Originally posted by cfocus20 at 2012-05-29 02:08:58
Q1: 必須將xxx.sqz檔案內(nèi)容copy至xxx.cif檔案在最後面, 這樣進(jìn)行cif check就不會(huì)出現(xiàn)上述這個(gè)問(wèn)題了!

sqz中的全部?jī)?nèi)容還是只要數(shù)據(jù)那部分粘貼到cif中呢？我試了下，檢查時(shí)提示加進(jìn)去sqz中的都是錯(cuò)誤。怎么回事啊？求指教！

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人生沒(méi)有彩排，每時(shí)每刻都是現(xiàn)場(chǎng)直播！

5樓2012-05-31 08:51:26

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cfocus20

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引用回帖:

5樓: Originally posted by 尚云鳳 at 2012-05-31 08:51:26
sqz中的全部?jī)?nèi)容還是只要數(shù)據(jù)那部分粘貼到cif中呢？我試了下，檢查時(shí)提示加進(jìn)去sqz中的都是錯(cuò)誤。怎么回事啊？求指教！...

抱歉是將sqf 裡面內(nèi)容複製到cif檔內(nèi)
sqf會(huì)有如下面所示內(nèi)容
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume,
# Recovered number of Electrons in the Void and
# Details about the Squeezed Material
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
  _platon_squeeze_void_content
1  0.000  0.000  0.000    331       50 ' '
2  0.000  0.000  0.500    332       50 ' '
3  0.500  0.500  0.500    332       50 ' '
4  0.500  0.500  0.000    331       50 ' '
_platon_squeeze_details
;
;

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6樓2012-05-31 15:30:32

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這個(gè)問(wèn)題要么使用PLATON程序中的squzee,要么就要將大量無(wú)序的水分子找出來(lái)，非常麻煩，如果是MOF的話就用第一種方法吧。

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7樓2012-05-31 23:06:32

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xiaohuiyi

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6樓: Originally posted by cfocus20 at 2012-05-31 15:30:32
抱歉是將sqf 裡面內(nèi)容複製到cif檔內(nèi)
sqf會(huì)有如下面所示內(nèi)容
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible V ...

謝謝

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8樓2012-09-06 21:47:27

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xiaohuiyi

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7樓: Originally posted by knight1014 at 2012-05-31 23:06:32
這個(gè)問(wèn)題要么使用PLATON程序中的squzee,要么就要將大量無(wú)序的水分子找出來(lái)，非常麻煩，如果是MOF的話就用第一種方法吧。

謝謝，是不是如果用squzee的話還需要其他方法來(lái)佐證溶劑分子是水或者什么其他分子？

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9樓2012-09-06 21:48:50

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引用回帖:

3樓: Originally posted by xiaochong98 at 2012-05-29 07:59:51
粉末與單晶模擬不一樣，考察一下，是否存在壓力轉(zhuǎn)晶，在研磨時(shí)溶劑揮發(fā)了。

請(qǐng)教一下，壓力轉(zhuǎn)晶什么表征手段可以看出來(lái)？

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10樓2019-03-05 11:13:27

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