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體系必須要電中性么?
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在一篇文章中,研究短肽和膜相互在作用,我怎么看到體系沒有電中性,也使用PME了,并且得到的結(jié)論是帶電的短肽對膜有穿孔的作用。文章鏈接http://www.sciencedirect.com/sci ... i/S0005273608001764謝謝了! 問題是,必須要使得體系電中性么? 現(xiàn)在的例子是這樣的,我有個(gè)大分子,帶了很多電荷,假設(shè)是100e,加入反離子-100e中和。 如果我要是不用pme(即shift),會發(fā)現(xiàn)反粒子不會全部集中在大分子上,并且體系越大,反粒子分布空間越大,則相對來講大分子上的反粒子越來越少。 這時(shí)候可以認(rèn)為大分子是帶純正電荷的,對于我的體系來講,大分子與膜的作用很明顯。 但是體系打了,計(jì)算量大了。 因此我想,我還是使用小體系,只是使得反粒子的數(shù)目少點(diǎn)就達(dá)到大體系的效果了,不知道這樣可以不可以:) [ Last edited by sxsfdx on 2012-6-3 at 15:08 ] |
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