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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » 其他 » SDF 編輯的問題
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alyse072988銀蟲 (正式寫手)
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[求助]
SDF 編輯的問題
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各位大俠們： 問一個基礎的問題，我們客戶要兩個10mg的化合物，但是問我們是否可以提供如下數(shù)據(jù)： What they need is an SDF file (pls find attached) including the following data: - structure including salt data, chiral flag - amount (unit = mg, max. 2 decimal places) - purity (without %, >, =; max. 2 decimal places) - "liquid handling" if needed -> you should indicate liquid handling "no" within the sd-file in a separate column, if the solubility in Dichloroethane/Methanol (1:1) is less than 5mg/ml, or if the compound evaporates at 40°C / 5mbar. 我本來以為SDF，就是簡單的chemdraw上畫一下結構式，保存為.sdf格式。然后我們可以按照需要，在里面添加分子式，分子量，純度，性狀等。 不過客戶的要求，讓我有如下問題： 1. structure including salt data, chiral flag，像這個要求，salt data，我不太清楚客戶的意思，是如果是成鹽的，如HCL, H2SO4，就把這個寫上去？如果是游離的，就寫free base? chiral flag, 我們并沒有測化合物的手性，是不是就如實寫不知道呢？ 2. "liquid handling" if needed -> you should indicate liquid handling "no" within the sd-file in a separate column, 這個我就按照他的旨意來添加進去就ok了 3. if the solubility in Dichloroethane/Methanol (1:1) is less than 5mg/ml, or if the compound evaporates at 40°C / 5mbar. 但是這個，如果實際上我們并沒有此數(shù)據(jù)，沒有做過，是否就都不要寫進去？ 盼高人指點迷津。 |
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alyse072988
銀蟲 (正式寫手)
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ylye
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3樓2013-11-25 14:41:37
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