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alexwpch木蟲 (正式寫手)
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[求助]
高斯計(jì)算中金屬離子與氯苯的相互作用結(jié)構(gòu)優(yōu)化錯(cuò)誤
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嘗試使用高斯研究金屬離子與氯苯的相互作用，在結(jié)構(gòu)優(yōu)化的時(shí)候始終沒有結(jié)果，出現(xiàn)各種錯(cuò)誤，主要是收斂問題。而且經(jīng)過優(yōu)化后有的金屬離子和氯苯會(huì)離得很遠(yuǎn)，這是初始構(gòu)型不正確嗎，需要如何改動(dòng)。 將各種錯(cuò)誤的輸入和輸出文件上傳，請(qǐng)各位專業(yè)人士幫忙分析下，重新提供些輸入方法。本人不是理論計(jì)算出身，所以可能會(huì)有些低級(jí)錯(cuò)誤，大家輕噴。其中有個(gè)唯一運(yùn)行正確的文件。[ Last edited by alexwpch on 2012-6-11 at 12:15 ] |
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alexwpch: 金幣+20, ★★★很有幫助, 謝謝哈，我試試這個(gè)方法看，先送你20金幣，再?zèng)]人回復(fù)的話剩下的都給你。 2012-06-12 09:09:13
gmy1990: 金幣+2 2012-06-12 09:22:02
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gmy1990: 金幣+2 2012-06-12 09:22:02
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我覺得你可以用Fragment來(lái)優(yōu)化試一試。不熟悉先不要用link，一步一步來(lái)····· （下面的坐標(biāo)是亂寫的··可能跟你的不一樣······，只是說一下Fragment的格式··） # ··············· Counterpoise=2 X 0 1 C(Fragment=1) +0.00000000 +0.00000000 +0.00000000 C(Fragment=1) +0.00000000 +0.00000000 +1.39516000 C(Fragment=1) +1.20775100 +0.00000000 +2.09269800 C(Fragment=1) +2.41626000 -0.00119900 +1.39504400 C(Fragment=1) +2.41618200 -0.00167800 +0.00021900 C(Fragment=1) +1.20797600 -0.00068200 -0.69738200 H(Fragment=1) -0.95231700 +0.00045000 -0.54975900 H(Fragment=1) -0.95251300 +0.00131500 +1.94466800 H(Fragment=1) +1.20783100 +0.00063400 +3.19237800 H(Fragment=1) +3.36840300 -0.00125800 +1.94524400 H(Fragment=1) +3.36846301 -0.00262292 -0.54990300 H(Fragment=1) +1.20815900 -0.00086200 -1.79698600 H(Fragment=2) +1.28409831 +1.81161709 +0.70347558 Ti(Fragment=2) +1.33116591 +2.91011442 +0.68530890 |
2樓2012-06-12 08:11:05
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alexwpch: 金幣+5, ★有幫助, 不只是L502，還有L9999等，還有其他金屬離子也是一樣的錯(cuò)誤。我試著加maxcyc=200，這種情況容易出現(xiàn)L9999錯(cuò)誤，qc沒加過。 2012-06-12 10:32:47
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| 2樓說的是bsse吧~~你如果主要是~收斂（l502）的問題的話，主要還是自洽場(chǎng)不收斂，在含fe的物質(zhì)中計(jì)算 常見錯(cuò)誤，加上（maxcycle=300，xqc）或者qc掉 比較合適~~ |
3樓2012-06-12 09:25:05
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試了你的方法，還是不收斂，L502錯(cuò)誤。 輸入文件如下: # opt=(cartesian) uhf/genecp Counterpoise=2 Zr 4,1 0,1 4,1 C(Fragment=1) 1.13913 -0.12117 -0.3112 C(Fragment=1) 2.45988 -0.4199 0.04978 C(Fragment=1) 3.34451 0.613 0.38812 C(Fragment=1) 2.90839 1.94462 0.36548 C(Fragment=1) 1.58764 2.24334 0.0045 C(Fragment=1) 0.70301 1.21044 -0.33384 H(Fragment=1) 0.4637 -0.90981 -0.56953 H(Fragment=1) 2.79287 -1.43662 0.06706 H(Fragment=1) 4.35294 0.38492 0.66373 H(Fragment=1) 3.58383 2.73326 0.6238 H(Fragment=1) 1.25466 3.26006 -0.01279 Cl(Fragment=1) -0.9557 1.58561 -0.7872 Zr(Fragment=2) -2.41086 -0.26799 -0.15452 Zr 0 Lanl2DZ **** C H 0 3-21G **** Cl 0 6-311G**(d,p) **** Zr 0 Lanl2DZ |
5樓2012-06-12 18:43:07
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不懂BSSE，我基本是自學(xué)的，從最簡(jiǎn)單的烷基苯的電子云密度開始學(xué)起，現(xiàn)在想進(jìn)一步。小卒的faq看過，但是沒全搞懂。不懂得只能先放一邊，什么時(shí)候用了，什么時(shí)候再看。而且，我是有機(jī)合成的，實(shí)驗(yàn)為主，大部分時(shí)間需要做實(shí)驗(yàn)和看相關(guān)文獻(xiàn)。 PS：終于知道為什么一些較有名的有機(jī)課題組都需要專門的做量化計(jì)算的人了。一個(gè)人同時(shí)學(xué)，做，看兩個(gè)方向很是痛苦啊，而且量化還是沒人指導(dǎo)，只能自己摸索。 再PS：我前面發(fā)過一個(gè)求助貼，請(qǐng)人幫我用G2或G3算一個(gè)小分子的生成熱，不知道你能不能幫下忙。 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=4576382 |
8樓2012-06-12 20:30:32
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