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[求助]
為什么在創(chuàng)建原子時(shí)有時(shí)候會(huì)出現(xiàn)多余的鍵？
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| 大家好，我是分子模擬的新手。在練習(xí)lammps自帶的算例時(shí)，運(yùn)行crack算例和indent算例，原子之間出現(xiàn)多余的化學(xué)鍵，不知道怎么回事，還有在算《金屬中的點(diǎn)缺陷：空位和間隙原子》這個(gè)網(wǎng)上下載的算例時(shí)，用create_atoms命令增加一個(gè)間隙原子后出現(xiàn)了化學(xué)鍵，覺(jué)得很奇怪，請(qǐng)教各位，不勝感激�。�！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-07-11 08:48:22
lyminghao: 金幣+4, ★★★很有幫助 2012-07-11 10:13:46
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-07-11 08:48:22
lyminghao: 金幣+4, ★★★很有幫助 2012-07-11 10:13:46
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你是怎么確定有多余的化學(xué)鍵的？ 是VMD看的原子間有多余的鍵？ 還是你把原子成鍵信息用文本輸出來(lái)，看到有多余的鍵？ 若是前者，不用擔(dān)心，因?yàn)閂MD默認(rèn)兩個(gè)原子之間的距離小于一定值的時(shí)候，就會(huì)顯示二者成鍵，即使真是情況是二者沒(méi)有成鍵，你需要確認(rèn)一下。 若是后者，你把多余的成鍵信息刪除即可。 |
2樓2012-07-11 07:48:56
3樓2012-07-11 09:44:58
4樓2012-07-11 09:49:04
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