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abigrabbit金蟲 (初入文壇)
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[求助]
求大神指導(dǎo)GMX,有機(jī)溶劑分子參數(shù)的編寫,和模擬一些重要地方修改
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ps ---越詳細(xì)越好![]() ![]() |
銀蟲 (小有名氣)
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送鮮花一朵
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金蟲 (小有名氣)
| 首先確定要用什么力場(chǎng),聯(lián)合的還是全原子的。聯(lián)合力場(chǎng)到prodrg網(wǎng)頁上獲得拓?fù)湮募。全原子力?chǎng)使用x2top命令獲得,但是itp文件的里的參數(shù)都不可靠,使用的時(shí)候有可能導(dǎo)致不給算。需要從文獻(xiàn)上或者自己算力場(chǎng)參數(shù),拿x2top產(chǎn)生的框架修改參數(shù)。不愿意一行行的改,就編個(gè)程序修改 |
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