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jackiewmh金蟲(chóng) (初入文壇)
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[交流]
怎么畫(huà)450+原子的三維杯芳烴分子 已有1人參與
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我們實(shí)驗(yàn)室很久以前合成了一個(gè)杯芳烴6，就是有六個(gè)苯環(huán)的那種。其中苯環(huán)的一端接氧原子和一個(gè)16碳的碳?xì)滏�，另一端接一個(gè)亞甲基連著的NMe3正離子 這個(gè)結(jié)構(gòu)我大概算了一下，總原子數(shù)450個(gè)左右，而且是環(huán)狀的。 我在Chemdraw上嘗試了很久，就算我在2d上畫(huà)全了，轉(zhuǎn)成3d后所有的對(duì)稱性都沒(méi)了，六個(gè)碳鏈橫七豎八的。而要直接在3d界面下畫(huà)，好像更加困難。 不知道有沒(méi)有方法算出來(lái)對(duì)稱性良好的，各個(gè)原子的坐標(biāo)，再導(dǎo)入到某個(gè)程序中，直接生成一個(gè)類似下圖的三維圖。  請(qǐng)大家推薦軟件，以及解決的思路，十分感謝。 p.s. 之前看到有牛人用gaussview構(gòu)建500+原子的分子，不知道是否適合用在我的個(gè)例上？另外， 我手頭有materials studio 4.0, chembio draw ultra 12.0. 都不是很精通。 |
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2樓2012-07-23 13:38:31
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