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蛋白3D結(jié)構(gòu),序列分析軟件Cn3DM中文說明書,
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Cn3D 是一個生物分子的三維結(jié)構(gòu)、序列以及序列比對結(jié)果的可視化工具。 Cn3D 可以將結(jié)構(gòu)與序列的信息緊密的聯(lián)系起來,這是它與其它軟件的一個重要的 區(qū)別:例如,一名科學(xué)家可以很快的從晶體結(jié)構(gòu)中找出與導(dǎo)致已知疾病的突變相 關(guān)的殘基,或是保留同源序列家族的活性位點的殘基。Cn3D 可以通過基于結(jié)構(gòu)的 序列比較來顯示生物分子結(jié)構(gòu)之間的比較,從而了解相關(guān)蛋白的那一個結(jié)構(gòu)域在 結(jié)構(gòu)與序列上表現(xiàn)得更為保守。同時,可以自定義標(biāo)簽的特性,高品質(zhì)的OpenGL 的畫質(zhì),還有多樣的文件輸出格式,都使得Cn3D 成為文獻(xiàn)注釋的強(qiáng)大工具。Cn3D 的特色就是通過網(wǎng)絡(luò)瀏覽器來作為NCBI 的Entrez 系統(tǒng)的一個輔助工具,但是它 也可以作為一個獨立的程序來使用。 在版本 4 當(dāng)中,Cn3D 已經(jīng)是一個完整的多序列比較編輯器了,除此之外, 還包括一條已知序列和其他序列或是其他結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較的算法。你可以新建一個 比對結(jié)果或是評價一個已有的結(jié)果。Cn3D 可以被用來作為比較CDD project內(nèi)容 的基本的輔助工具。(保守結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫) |
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