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lijuanshu

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[交流] 用NEB計(jì)算能壘，為什么從次穩(wěn)定位置擴(kuò)散到穩(wěn)定位置和其相反過(guò)程所計(jì)算得能壘相同？？

各位蟲(chóng)子們，大家好，我在用NEB計(jì)算能壘的時(shí)候，取8個(gè)點(diǎn)，H原子從表面的次穩(wěn)定位置擴(kuò)散到最穩(wěn)定位置的各個(gè)能量如下：
00：-173.41179
01：-173.35976
02：-173.08914
03：-172.86400
04：-172.80730
05：-172.83323
06：-172.94465
07：-173.18817
08：-173.38228
09：-173.42062
能量最低點(diǎn)與最高點(diǎn)的差值為0.613
其相反過(guò)程，也就是從最穩(wěn)定位置擴(kuò)散到此穩(wěn)定位置，各能量為：
00：-173.42062
01：-173.38227
02：-173.18806
03：-172.94459
04：-172.83321
05：-172.80731
06：-172.86399
07：-173.08906
08：-173.35973
09：-173.41179
能量最低點(diǎn)與最高點(diǎn)的差值為也0.613，如果從最后一行倒過(guò)來(lái)看，所有的能量與前面過(guò)程的相同，不過(guò)這兩個(gè)相反過(guò)程的能壘應(yīng)該不一樣啊，不知道為什么，還請(qǐng)蟲(chóng)友們幫忙解決，不勝感激

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1樓 2012-08-14 08:49:49

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lu881688

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lijuanshu(金幣+1): 謝謝參與
WDD880227: 金幣+1, 多謝提示 2012-08-15 08:58:20

00 應(yīng)該是一個(gè)穩(wěn)態(tài)，09 應(yīng)該是另一穩(wěn)態(tài)。能量差距小，正、逆向勢(shì)壘接近也可以理解嘛。

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2樓2012-08-14 09:28:08

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lijuanshu

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引用回帖:

2樓: Originally posted by lu881688 at 2012-08-14 09:28:08
00 應(yīng)該是一個(gè)穩(wěn)態(tài)，09 應(yīng)該是另一穩(wěn)態(tài)。能量差距小，正、逆向勢(shì)壘接近也可以理解嘛。

但是文獻(xiàn)上算出來(lái)的能壘都是不一樣的，并且我算另一個(gè)體系的初態(tài)能量是-202.76940，末態(tài)能量是-202.92948，它的能壘與逆過(guò)程的能壘還是一樣的，這是為什么��？

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3樓2012-08-14 09:40:59

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scnlong

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lijuanshu(金幣+1): 謝謝參與

我覺(jué)得一樣才是正常啊。

正逆過(guò)程走的都是同一個(gè)路徑，能壘應(yīng)該一樣的。

樓主為什么覺(jué)得應(yīng)該不一樣？

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4樓2012-08-14 11:49:47

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4樓: Originally posted by scnlong at 2012-08-14 11:49:47
我覺(jué)得一樣才是正常啊。

正逆過(guò)程走的都是同一個(gè)路徑，能壘應(yīng)該一樣的。

樓主為什么覺(jué)得應(yīng)該不一樣？

怎么說(shuō)呢，這個(gè)意義我也不是太懂，總是覺(jué)得從最穩(wěn)定位置擴(kuò)散的次穩(wěn)定位置與其逆過(guò)程的意義不同，所需要克服的能壘也是不同的，我看的一些文獻(xiàn)中的正逆過(guò)程的能壘值都是不同的

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5樓2012-08-14 13:28:23

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cenwanglai

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lijuanshu(金幣+1): 謝謝參與

引用回帖:

5樓: Originally posted by lijuanshu at 2012-08-14 13:28:23
怎么說(shuō)呢，這個(gè)意義我也不是太懂，總是覺(jué)得從最穩(wěn)定位置擴(kuò)散的次穩(wěn)定位置與其逆過(guò)程的意義不同，所需要克服的能壘也是不同的，我看的一些文獻(xiàn)中的正逆過(guò)程的能壘值都是不同的...

應(yīng)該都是一樣的。

可以理解為一個(gè)人在同一條路上來(lái)回走。路上海拔最高點(diǎn)與最低點(diǎn)之差是沒(méi)有變化的。因?yàn)槁范际且粯拥摹?

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7樓2012-08-14 18:04:07

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lijuanshu

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7樓: Originally posted by cenwanglai at 2012-08-14 18:04:07
應(yīng)該都是一樣的。

可以理解為一個(gè)人在同一條路上來(lái)回走。路上海拔最高點(diǎn)與最低點(diǎn)之差是沒(méi)有變化的。因?yàn)槁范际且粯拥摹?..

那怎么解釋文獻(xiàn)中計(jì)算得正逆過(guò)程的能壘值是有差別的，難道是取的路勁不同?

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8樓2012-08-14 19:08:26

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魔鬼中的天使

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lijuanshu(金幣+1): 謝謝參與

這個(gè)。。。
能壘應(yīng)該都是用能量極大值減初始能量值吧
就是說(shuō)次穩(wěn)定態(tài)容易去穩(wěn)定態(tài)（能壘低）
但穩(wěn)定態(tài)去次穩(wěn)定態(tài)較難（能壘高）
你這個(gè)計(jì)算結(jié)果沒(méi)什么問(wèn)題
走的路徑一樣，自然各個(gè)點(diǎn)能量一樣

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9樓2012-08-14 19:53:41

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scnlong

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8樓: Originally posted by lijuanshu at 2012-08-14 19:08:26
那怎么解釋文獻(xiàn)中計(jì)算得正逆過(guò)程的能壘值是有差別的，難道是取的路勁不同?...

你看到的是哪篇文獻(xiàn)？

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10樓2012-08-14 20:20:47

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9樓: Originally posted by 魔鬼中的天使 at 2012-08-14 19:53:41
這個(gè)。。。
能壘應(yīng)該都是用能量極大值減初始能量值吧
就是說(shuō)次穩(wěn)定態(tài)容易去穩(wěn)定態(tài)（能壘低）
但穩(wěn)定態(tài)去次穩(wěn)定態(tài)較難（能壘高）
你這個(gè)計(jì)算結(jié)果沒(méi)什么問(wèn)題
走的路徑一樣，自然各個(gè)點(diǎn)能量一樣

按你的意思，從次穩(wěn)定位置到最穩(wěn)定位置的能壘低，而從最穩(wěn)定位置到次穩(wěn)定位置的能壘高，是這樣理解的嗎？如果是，我就是想問(wèn)為什么我從次穩(wěn)定到最穩(wěn)定與從最穩(wěn)定到次穩(wěn)定的能壘相同啊？

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11樓2012-08-14 21:15:20

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10樓: Originally posted by scnlong at 2012-08-14 20:20:47
你看到的是哪篇文獻(xiàn)？...

First principles calculations of the adsorption and diffusion of hydrogen on Fe(1 0 0) surface and in the bulk
文中說(shuō)到The above results indicate that the diffusion barrier between 2F and 4F sites is quite small with values of 1.93 and 1.77 kcal/mol for direct and reverse pathways.

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12樓2012-08-14 21:20:47

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leozpj

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★
lijuanshu(金幣+1): 謝謝參與

哪位能幫忙解釋一下計(jì)算neb順利收斂，用nebbarrier.pl生成了neb.dat文件以后，再用nebspline.pl命令顯示出了一下報(bào)錯(cuò)信息:"Illegal division by zero at /public/home/pjzuo/bin/nebspline.pl line 70.”

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13樓2012-11-06 10:31:48

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簡(jiǎn)單回復(fù)

dingdingkeai6樓

2012-08-14 14:15 回復(fù)

lijuanshu(金幣+1): 謝謝參與

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