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ArthurFSun

鐵蟲 (小有名氣)

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在線: 35.7小時
蟲號: 1529073
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專業(yè): 病毒學(xué)

[求助] clustalw 為什么選擇1回車后1被刪除,程序不運行

在linux系統(tǒng)下,我輸入clustalw2命令, 返回以下提示:
**************************************************************
******** CLUSTAL 2.1 Multiple Sequence Alignments  ********
**************************************************************

   1. Sequence Input From Disc
   2. Multiple Alignments
   3. Profile / Structure Alignments
   4. Phylogenetic trees

   S. Execute a system command
   H. HELP
   X. EXIT (leave program)
Your choice:

我輸入1, 回車,出現(xiàn):
Sequences should all be in 1 file.

7 formats accepted:
NBRF/PIR, EMBL/SwissProt, Pearson (Fasta), GDE, Clustal, GCG/MSF,                RSF.

Enter the name of the sequence file :

我輸入了我的fasta格式的序列文件名,回車,出現(xiàn):

Sequence format is Pearson

**************************************************************
******** CLUSTAL 2.1 Multiple Sequence Alignments  ********
**************************************************************

   1. Sequence Input From Disc
   2. Multiple Alignments
   3. Profile / Structure Alignments
   4. Phylogenetic trees

   S. Execute a system command
   H. HELP
   X. EXIT (leave program)

Your choice:
我選擇2,回車,出現(xiàn):
****** MULTIPLE ALIGNMENT MENU ******

1.  Do complete multiple alignment now Slow/Accurate
2.  Produce guide tree file only
3.  Do alignment using old guide tree file

4.  Toggle Slow/Fast pairwise alignments = SLOW

5.  Pairwise alignment parameters
6.  Multiple alignment parameters

7.  Reset gaps before alignment? = OFF
8.  Toggle screen display       = ON
9.  Output format options
I. Iteration = NONE

S.  Execute a system command
H.  HELP
or press [RETURN] to go back to main menu

Your choice:
我輸入1,回車,結(jié)果1被刪除,程序不運行,試了無數(shù)次都是這樣,哪位知道這是為什么呀?謝謝了!

回復(fù)此樓

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1樓 2012-08-21 07:55:21

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

daohuahe

銅蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 作物分子育種

【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★
fegg7502: 金幣+3, 3ks 2012-09-08 10:58:33

序列文件有問題，好好檢查檢查！我曾也遇到過這種情況。

贊一下

回復(fù)此樓

2樓2012-09-08 07:42:58

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

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