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[求助]
NBO分析
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| 我是新手，想請問一下NBO分析中，一個(gè)含苯環(huán)的化學(xué)物，如果要計(jì)算苯環(huán)的電子數(shù)變化和電荷轉(zhuǎn)移，是不是把苯環(huán)上的六個(gè)碳原子的電子數(shù)加起來和未變化之前的電子數(shù)比較呢？謝謝 |
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lishijunzong
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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3樓2012-09-03 09:36:23
4樓2012-09-03 15:45:17
wang_dan1990
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+2 2012-09-03 19:41:37
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gmy1990: 金幣+2 2012-09-03 19:41:37
| “我還想問一下如果比較兩個(gè)分子的電荷數(shù)，比如NBO分析后（加了溶劑模型）一個(gè)分子的電荷數(shù)是0.0083.另一個(gè)是0.00001，可以說明前一個(gè)分子和和吸附劑形成的靜電作用強(qiáng)嗎？電荷數(shù)可以說明什么問題呢？”一個(gè)分子，它的電荷數(shù)不應(yīng)該是0嗎？如果想比較和吸附劑形成的靜電作用，我建議，分別做這兩個(gè)分子使用溶劑和不使用溶劑的NBO分析，然后將使用溶劑和不使用的電荷數(shù)的差值進(jìn)行比較。差值大，說明靜電力強(qiáng)。 |
5樓2012-09-03 16:31:16
sobereva
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+3 2012-09-03 19:41:42
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gmy1990: 金幣+3 2012-09-03 19:41:42
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不能這么說明靜電作用強(qiáng)弱。 如果你用的是隱式溶劑模型（PCM等），分子總電荷數(shù)的差異屬于數(shù)值精度問題，沒有物理意義。對于中性分子，精確結(jié)果都應(yīng)當(dāng)為0。 就算用的是顯式溶劑模型，靠分子整體的凈電荷也幾乎沒法直接和靜電相互作用強(qiáng)度聯(lián)系起來。最粗糙的表示靜電相互作用強(qiáng)弱的方法是用原子電荷根據(jù)庫侖定律來算分子間靜電作用能。 如果想更精確一些描述這個(gè)問題，可以做能量分解，比較其中靜電部分能量大小。 |
6樓2012-09-03 19:12:57
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