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daniell251

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10樓: Originally posted by daniell251 at 2012-09-07 16:09:35
I'm not the guy who is on computational chemistry major. So what I learned about DFT are all from xiaomuchong. Meanwhile, there is no professor who can teach this specific area, although someone is ...

correct: there is no professor in my department...

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11樓2012-09-08 12:11:17

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8樓: Originally posted by 思雨G十年 at 2012-09-08 11:47:45
對的，就是改動%rwf這一行，加大硬盤。如果你把硬盤都用了還是不行的話，只能換方法了。其實“魚妃”說的對，弱相互作用，DFT方法在基組合適的情況下是能描述的很好的。只是MP2一直被公認為很精確的方法，甚至某些 ...

謝謝思雨夸獎
其實如果他把硬盤都用了還是不行的話，又非要用mp2，倒是不妨用ri

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12樓2012-09-08 14:46:51

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11樓: Originally posted by daniell251 at 2012-09-08 12:11:17
correct: there is no professor in my department......

呵呵其實 mp2解決弱作用問題耗時長精度低
DFT發(fā)展了很多方法來計算弱作用問題耗時短精度高（這還真不是瞎話，確實精度高于mp2了）
那么哪些DFT能夠比較好的描述弱作用問題？
=====以下轉(zhuǎn)載自sobereva的博客========
B97D:Grimme 2007年的，和D2一起提出來的，B97結(jié)合了DFT-D2校正，Gaussian09中已經(jīng)能用。畢竟D3后來被提出來了，而且用更大訓練集參數(shù)化，B97D就別用了。
revPBE-D3:修改版PBE結(jié)合DFT-D3，是GGA-D3中最出色的，對各種問題都很好。當然還是不如色散校正的雜化、雙雜化泛函。必須用GGA且可以用色散校正時就用這個。
SSB-D:前面提過了，其作者鼓吹其很好，一些困難體系別的都不靈它靈。我也對此泛函印象不錯，但是目前還沒有被程序廣泛支持。注意SSB-D3在Grimme的PCCP文中的比較中表現(xiàn)并不好，一方面是可能D3不適合它（而適合D2），也可能是訓練集不同，也可能是作者鼓吹SSB-D時所用的測試集太小不足以說明問題。這個問題有待繼續(xù)考察，反正我目前認為SSB-D可以放心用在弱相互作用體系。
M06-2X-D3:即使不用DFT-D，這東西算弱相互作用本身已經(jīng)不錯，而且已被廣泛支持，而且還可以把弱相互作用效應引入密度中。用了DFT-D3后，各方面都無敵！無論弱相互作用還是計算反應能、原子化能之類，在Grimme的泛函-D3橫評中是雜化泛函里最好的。但是有可能不好收斂，但如果收斂沒問題的話，推薦用這個。
PW6B95-D3:色散校正雜化泛函測試里僅次于M06-2X-D3，如果M06-2X-D3使用有問題，就用這個。同樣地，各方面都很好，不僅限于弱相互作用好。
ωB97X-D:Head Gordon于2008年弄的，在ωB97X上加了色散校正并重新參數(shù)化，其中阻尼系數(shù)函數(shù)形式與Grimme D2有所不同。在g09可以直接用wB97XD關鍵詞使用之。由于同時擁有LC和色散校正，比較全能，算弱相互作用、TDDFT都很好，熱化學計算也是色散校正雜化泛函里很好的。但色散校正并不像Grimme DFT-D那樣給原始泛函其它方面也帶來好處，ωB97X-D相對于ωB97X只有色散作用有改進，其它無明顯改進（可能LC-已經(jīng)解決了不少中程相關問題，沒有DFT-D插足余地了），對TDDFT略微惡化。總之ωB97X-D是很絕妙的，可以放心地用于任何問題（原理上可代替B3LYP，但由于計算速度明顯慢，所以酌情使用）。
MP2:算氫鍵很好，弱相互作用容易高估，即結(jié)合得過于穩(wěn)定，當然，還是比普通DFT好得多。比DFT需要更大的基組，由于已經(jīng)有了更好的雙雜化泛函，就沒必要用了。
SCS-MP2:算色散作用比MP2好，達到雙雜化泛函的水平，但氫鍵不如MP2，算反應能頗好。其它方面沒比MP2有什么提高。至于其它變種，如SOS-MP2、S2-MP2之類還不如MP2。畢竟雙雜化泛函整體表現(xiàn)更好，除非密度泛函不能用，比如SIE問題明顯時，才應該用這個。
B2PLYP:最早提出的雙雜化泛函。畢竟引入了MP2，弱相互作用好于一般DFT，但不如DFT-D，何況計算耗時明顯增加，別用它。
B2PLYP-D3:各方面總是比B2PLYP好，但不一定比最好的雜化泛函-D3更好。不要用。
DSD-BLYP-D3:雙雜化泛函DSD-BLYP加上D3色散校正，在四zeta下Grimme號稱它是目前綜合性能最出色的色散校正泛函，不僅對于弱相互作用，對其它問題也最好。
PWPB95-D3:雙雜化泛函，三zeta下它是最棒的色散校正泛函，對各種問題都很好，四zeta下僅次于DSD-BLYP-D3。
CCSD(T):基組外推到CBS時是弱相互作用的金標準。錢多得沒處花就用它

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13樓2012-09-08 14:54:58

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I'm not the guy who is on computational chemistry major. So what I learned about DFT are all from xiaomuchong. Meanwhile, there is no professor who can teach this specific area, although someone is ...

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mp2算遠程作用確實存在又慢又不準的問題
再說了人家咋說你就咋信啊您也太……嘿嘿嘿
我在我的文獻管理器里隨手一翻，就翻出來一大堆文獻，這些都是用DFT算遠程作用的
S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27, 1787
L. Georigk, S. Grimme, J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 291
D. Qi, L. Zhang, L. Wan, L. Zhao, J. Jiang, J. Phys. Chem. A, 2012, 116, 6785
M. Piacenza, S. Grimme, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 14841
E. Hulkko, T. Kiljunen, T. Kiviniemi, M. Pettersson, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1050
K. Matsumura, T. Mori, Y. Inoue, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17076
Z. Zhang, R. Rousseau, J. Gong, B. D. Kay, Z. Dohnalek, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17926
T. Schwabe, S. Grimme, J.-P. Djukic, J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 14156
W. Sun, Y. Bu, Y. Wang, J. Phys. Chem. C, 2011, 115, 3220
S. Grimme, Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 3430
T. Schwabe, S. Grimme, Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 3397
S. Grimme, C. Muck-Lichtenfeld, J. Antony, J. Phys. Chem. C 2007, 111, 11199
G. A. Shamov, P. H. M. Budzelaar, G. Schreckenbach, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 477;
S. Janich, R. Frohlich, A. Wakamiya, S. Yamaguchi, E. -U. Wurthwein, Chem. Eur.
J. 2009, 15, 10457;
P. Rydberg, L. Olsen, J. Phys. Chem. A 2009, 113, 11949;
S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27, 1787;
U. Salzner, A. Aydin, J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 2568;
T.-K. Hwang, G.-Y. Eom, M.-S. Choi, J. Phys. Chem. B 2011, 115, 10147;
J. Arago, J. C. Sancho-Garcia, E. Orti, D. Beljonne, J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 2068;
H. Choi, Y. C. Park, Y.-H. Kim, Y. S. Lee, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 2084;
B. Tian, E. S. E. Eriksson, L. A. Eriksson, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 2086;
R. Nasiri, M. J. Field, M. Zahedi, A. A. Moosavi-Movahedi, J. Phys. Chem. A 2011, 115, 13542.

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15樓2012-09-08 15:13:15

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mp2有高估弱相互作用的缺點。如果非要用mp2，那么SCS-MP2解決了一定的問題，如果是在算不動可以用ri-scs-mp2

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16樓2012-09-08 15:15:14

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14樓: Originally posted by 魚妃 at 2012-09-07 18:59:03
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...

我所指的遠程作用是在金屬和金屬間的遠程作用不知道魚妃有什么見解嗎

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17樓2012-09-09 02:06:24

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15樓: Originally posted by yjcmwgk at 2012-09-07 19:13:15
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S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27, ...

我這不是孤軍奮戰(zhàn)嗎而且還是ACIE里面的文章所以姑且認為是可行的再來小木蟲求教

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18樓2012-09-09 02:07:34

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14樓: Originally posted by 魚妃 at 2012-09-07 18:59:03
recent Angewant and Chem. Soc. Rev. (both are from this year.)

現(xiàn)在還有人敢說這話��？文獻的卷期號頁碼給一下吧

...

文獻號是 ACIE 2012, 51, 5924

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19樓2012-09-09 02:08:29

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yjcmwgk 能看一下 ACIE, 2012, 51, 5924 嗎這篇文章說的是Au-Au的遠程作用不能被DFT很好的模擬

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20樓2012-09-09 02:09:32

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