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構建系統(tǒng)發(fā)育樹的問題
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| 我現(xiàn)在要鑒定幾株細菌是否為新種,測出16srDNA后,在韓國的EzBioCloud網(wǎng)站進行identity,將出來的一頁數(shù)據(jù)用fasta輸出,然后放到clustalX中進行多序列比對,去頭尾之后用mega轉化成.meg用NJ建樹,結果出來之后很多節(jié)點的數(shù)值都非常低,請問為什么會出現(xiàn)這種情況?我是用58個種建的發(fā)育樹,請問需不需要再去掉一些種,用離目標菌比較近的10株左右菌種再建一個樹呢?另外,如果發(fā)表論文的話,是用original tree撰寫論文還是用Bootstrap consensus tree呢? |
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