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dndxwoaini新蟲 (小有名氣)
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[求助]
怎么樣生成4M的Kcl溶液
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我用vmd的加離子插件加kcl到4M就死機了，加3M沒問題。 不知大家有什么好的方法是kcl濃度到達4M？ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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resetpsf mol load psf sin_hex.psf pdb sin_hex.pdb set conc 1.0 set water [atomselect top "name OH2"] set num [expr {int(floor($conc*[$water num]/(55.523 + 2.0*$conc) + 0.5))}] package require autoionize autoionize -psf sin_hex.psf -pdb sin_hex.pdb -nna $num -ncl $num -o sin_ions package require autoionizegui set Autoi:  utprefix sin_ionsset Autoi::ksegid POT Autoi::sod2pot 你把這段例子里的腳本看明白，自己寫個tcl腳本就可以了。 |
2樓2012-09-10 22:43:03
dndxwoaini
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
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3樓2012-09-13 20:49:17
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