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zhangsdtz金蟲 (小有名氣)
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[求助]
VMD如何利用.xyz文件計算g(r)?
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VMD導入.xyz 文件后,Extensions-Analysis-Radial pair distribution function后無法計算,出現如下錯誤: “There was an error creating the selections: atomselect: cannot parse selections text.” 是什么原因? 另外,如何xyz文件轉化為PDB文件?(我是初學者,不太懂VMD) |
科研工具資源Nick |
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關于計算你可以看看這里http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/gofrgui/ 第二個問題“如何xyz文件轉化為PDB文件?” 你是初學者,建議你去看看VMD的手冊,VMD是免費的軟件。 具體方法, 一種:你可以把xyz文件導入到VMD之中,然后保存成PDB 格式就行了。 步驟如下: 第二種:使用命令 這兩個命令很簡單,看懂這兩個命令的具體意思,作為你學習VMD的開始吧。 VMD 的所有操作都可以使用命令來實現。 set all [atomselect top all] $all writepdb sio2.pdb [ Last edited by jiaoyixiong on 2012-9-28 at 22:18 ] |
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