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zhlf1989513金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
引物設(shè)計(jì) 求助
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我的基因是個(gè)假基因，pubmed上名為CYP4Z2P，我想P一下它的ＣＤＳ區(qū)，誰(shuí)能幫我設(shè)計(jì)一下引物，我設(shè)計(jì)了很多對(duì)引物試了很多次都不成功，甚是郁悶�。。� ＣＤＳ去序列為： ４atggagc cctcctggct tcaggaactc atggctcacc ccttcttgct gctgatcctc 61 ctctgcatgt ctctgctgct gtttcaggta atcaggttgt accagaggag gagatggacg 121 atcagagcca tgcacctgtt tcctgcaccc cctgcgcact ggttctatgg ccacaaggag 181 tcttacccag taaaagagtt tgaggtgtat cctgagctga tggaaaaata cccatgtgcc 241 gttcccttgt gggttggacc ctttacgatg ttcttcaata tccatgaccc agactatgtc 301 aagattctcc tgaaaagaca agatcccaaa agtgctgtta gccacaaaat ccttgaatcc 361 tgggttggtc gaggacttgt gaccctggat ggttctaaat ggaaaaagca ccgccagatt 421 gtgaaacctg gcttcaacat cagcattctg aaaatattca tcaccatgat gtctaagagt 481 gttcggatga tgctgaacaa atgggaggaa cacattgccc aaaactcacg tctggagctc 541 tttcaacatg tctccctgat gaccctggac agcatcatga agtgtgcctt cagccaccag 601 ggcagcatcc agttggacag taccctggac tcatacctga aagcagtgtt caaccttagc 661 aaaatctcca accagcgcat gaacaatttt ctacatcaca acgacctggt tttcaaattc 721 agctctcaag gccaaatctt ttctaaattt aaccaagaac ttcatcagtt cacagagaaa 781 gtaatccagg accggaagga gtctcttaag gataagctaa aacaagatac tactcagaaa 841 agacgccagg attttctgga catacttttg agtgccaaaa gtgaaaacac caaagacttc 901 tctgaagcag atctccaagc tgaagtgaaa acgttcatgt ttgcaggaca tgacaccaca 961 actactgcta tctcctggat cttttactgc ttggcaaagt accctgagca tcagcagaga 1021 tgctg [ Last edited by 1949stone on 2012-10-8 at 07:30 ] |
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2樓2012-10-07 14:40:43
3樓2012-10-07 15:06:14
zhlf1989513
金蟲(chóng) (小有名氣)
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4樓2012-10-07 15:15:39
zhlf1989513
金蟲(chóng) (小有名氣)
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5樓2012-10-07 15:17:28
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
小丹木木: 金幣+2, 鼓勵(lì)應(yīng)助 2012-10-08 14:00:41
小丹木木: 金幣+2, 鼓勵(lì)應(yīng)助 2012-10-08 14:00:41
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哦，樓主的意思是你在一樓提供的CDS是所謂的正基因，而你想從模板中P出來(lái)的是假基因了，而你的假基因通過(guò)BLAST跟這個(gè)正基因同源性最高。如此看來(lái)的話(huà)通過(guò)樓主提供的CDS是不容易P出目的基因的，因?yàn)槟康幕蚝芸赡茉谇岸胃┒硕寂c正基因有出入。個(gè)人認(rèn)為，樓主首先要確認(rèn)模板中是否一定含有目的基因，其次就是根據(jù)目的基因的保守序列設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物進(jìn)行PCR。 |
6樓2012-10-08 00:16:15
zhlf1989513
金蟲(chóng) (小有名氣)
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7樓2012-10-08 08:20:28
review
銀蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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8樓2012-10-25 17:15:47
9樓2012-10-28 12:25:28
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