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香樟樹2011新蟲 (初入文壇)
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[求助]
clustal軟件怎樣使用啊，有相關(guān)教程嗎
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初接觸生物信息學(xué)，需要對(duì)蛋白質(zhì)氨基酸進(jìn)行序列分析，不知道怎樣做。 輸入比對(duì)序列是怎樣輸入呢？ 總之，各種不懂啊 |
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 生信 |
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gwd0312
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
小丹木木: 金幣+3, 鼓勵(lì)應(yīng)助 2012-10-08 14:06:38
1949stone: 回帖置頂 2012-10-08 16:42:39
1949stone: 可以詳細(xì)說一下 他的功能還有一些 2012-10-08 16:43:38
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1949stone: 可以詳細(xì)說一下 他的功能還有一些 2012-10-08 16:43:38
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我用的是英文版的，現(xiàn)將序列分析過程解釋如下： 首先點(diǎn)擊clustalx.exe打開程序；點(diǎn)擊File---Load sequences載入序列（序列格式要求是文本文檔）； 接下來點(diǎn)擊Alignment-----Do Complete Alignment，彈出對(duì)話框之后點(diǎn)擊align就OK了。 有什么問題歡迎繼續(xù)交流！ |
2樓2012-10-08 12:43:53
香樟樹2011
新蟲 (初入文壇)
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3樓2012-10-08 13:46:04
cicelyzh
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【答案】應(yīng)助回帖
★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
1949stone: 金幣+1, good 2012-10-08 16:42:52
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| 到這里下載，http://www.clustal.org/。軟件使用不難，按照2樓提示的做就行了。 |
4樓2012-10-08 14:46:33
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
1949stone: 回帖置頂 2012-10-08 16:42:56
1949stone: 回帖置頂 2012-10-08 16:42:56
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Clustal的使用總結(jié)（Clustalx+Clustalw） Clustal包括Clustalx和Clustalw（前者是圖形化界面版本后者是命令界面），是生物信息學(xué)常用的多序列比對(duì)工具。 最近要針對(duì)人、小鼠、大鼠、猴進(jìn)行siRNA藥物設(shè)計(jì)，其中要用到多序列比對(duì)的顯示結(jié)果。我選用了Clustal，使用時(shí)的記錄如下： 1.官方下載地址：http://www.clustal.org/download/current/，下載linux版本clustalw-2.1.tar.gz 2，解壓并安裝 $ ./configure $ make $ make install 3,運(yùn)行多序列比對(duì) clustalw2 -INFILE=test.fa -OUTPUT=CLUSTAL -OUTFILE=test.out -SEQNOS=ON BY bdc_0100 seq.cn |
5樓2012-10-08 15:58:57
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