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zhang_jaj木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
lammps計(jì)算cna/atom
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| 我是用MC模擬結(jié)晶過(guò)程的，得到了原子的坐標(biāo)文件，現(xiàn)在想用cna來(lái)分析他們的結(jié)構(gòu)情況。但是從來(lái)沒(méi)有用過(guò)lammps，所以想問(wèn)下有用過(guò)的，做我這個(gè)的大概流程是怎么回事，然后我好自己去學(xué)習(xí)，現(xiàn)在沒(méi)有頭緒啊。非常感謝！ |
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先將數(shù)據(jù)寫(xiě)成lammps要求的格式，如下： --------------------------------- LAMMPS data file 960 atoms 3 atom types -15.00 15.00 xlo xhi 0.00 100.00 ylo yhi -0.15 0.15 zlo zhi Masses 1 12.01 2 12.01 3 12.01 Atoms 1 1 0.710 0.000 0.000 ... --------------------------------- 之后用read_data讀入即可。 |
2樓2012-10-11 19:12:34
zhang_jaj
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送鮮花一朵 |
非常感謝�。∥业氖莾煞Natom（ar和C）在一個(gè)60埃的box里面，我只想用lammps分析ar最后的結(jié)構(gòu)。是不是這個(gè)應(yīng)該寫(xiě)成 LAMMPS data file 960 atoms（c和ar的總數(shù)嗎） 2 atom types 0.00 60.00 xlo xhi 0.00 60.00 ylo yhi 0.00 60.00 zlo zhi Masses 1 39.94 2 12.01 Atoms 1 1 0.710 0.000 0.000 .... 是不是應(yīng)該寫(xiě)成這樣，謝謝 |
3樓2012-10-12 09:13:51
bluewhale
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4樓2012-10-12 09:56:10
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