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crispsoft

金蟲 (小有名氣)

應助: 0 (幼兒園)
金幣: 1338.1
散金: 11
帖子: 76
在線: 82.5小時
蟲號: 628150
注冊: 2008-10-16
專業(yè): 合成藥物化學

[求助] 關(guān)于G-H方法驗證藥效團的有效性的問題

請問有沒有熟悉藥效團篩選的同學，咨詢一個問題：文獻中提到用G-H方法驗證藥效團的有效性，常常從DUD網(wǎng)站下載數(shù)據(jù)庫作為測試集。
但是該網(wǎng)站的很多測試集似乎是對應于特定受體的，
請問如果研究的受體不在其中，是否就不能用他們提供的誘餌測試集了？

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1樓 2012-10-13 22:36:16

已閱回復此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

isus8826

新蟲 (初入文壇)

應助: 2 (幼兒園)
金幣: 1290.8
紅花: 1
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蟲號: 1487390
注冊: 2011-11-11
專業(yè): 合成藥物化學

【答案】應助回帖

★
chaizhm: 金幣+1, 謝謝~ 2012-11-11 10:38:27

藥效團一般都是要做decoy 測試的你decoy數(shù)據(jù)庫中的陰性分子可以隨機從數(shù)據(jù)庫中選取，也可以按照構(gòu)建DUB數(shù)據(jù)庫的方法自己建，一般會用到指紋圖譜和物理性質(zhì)的相似性篩選。

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回復此樓

2樓2012-11-10 16:49:49

已閱回復此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

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