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如何實(shí)現(xiàn)模擬一個(gè)反應(yīng) 或者預(yù)測反映結(jié)果
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| 如何模擬實(shí)現(xiàn)不同溫度下或者其他條件下氧化鎂與氧化鋁反應(yīng)生成產(chǎn)物預(yù)測的模擬 或者反應(yīng)過程的模擬。 |
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ChemiAndy
木蟲 (正式寫手)
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
5487123: 金幣+5, 很熱情的回復(fù) 2012-10-19 14:26:58
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5487123: 金幣+5, 很熱情的回復(fù) 2012-10-19 14:26:58
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估計(jì)你是想看看以不同的動(dòng)能驅(qū)動(dòng)分子的隨機(jī)碰撞，平衡后統(tǒng)計(jì)最后的產(chǎn)物分布。這樣要跑基于第一原理的分子動(dòng)力學(xué)模擬。完了后通常還需要評估產(chǎn)物的穩(wěn)定性。 然而，我覺得這其中有很大的問題。第一是這樣的反應(yīng)的特征時(shí)間你最好事先知道。如果是ns級的話就悲催了，因?yàn)榈谝辉韯?dòng)力學(xué)一般跑不了那么長時(shí)間。大概都是幾十個(gè)最多幾百個(gè)ps吧。不知道你的機(jī)器給力不？第二是反應(yīng)初始態(tài)的構(gòu)型問題。反應(yīng)有很大的隨機(jī)性、不確定性，如果你的初始態(tài)處在一個(gè)不利于反應(yīng)的狀態(tài)，那么你跑完也看不到什么明顯的變化。因此，預(yù)先分析可能的路徑很重要。第三，還是隨機(jī)性的問題。你或者需要構(gòu)建一個(gè)很大的體系包括盡可能多的反應(yīng)物，或者構(gòu)建一個(gè)小盒子，然后嘗試多個(gè)不同的初始構(gòu)型，跑很多個(gè)trajectories，這樣才能夠得到有顯著意義的統(tǒng)計(jì)結(jié)果。最后，不要期望你的結(jié)果能跟實(shí)驗(yàn)一致。因?yàn)镈FT計(jì)算反應(yīng)勢能面的準(zhǔn)確性還是個(gè)問題。偏差1eV是很平常的。如果你要是有金屬，那更麻煩，誤差更大。所以這一類的研究基本上只能為解釋一些實(shí)驗(yàn)結(jié)果做些參考。提供一些理論上可能的結(jié)果，合理性均需實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。這一點(diǎn)才做結(jié)論的時(shí)候非常重要，需要特別謹(jǐn)慎。 看你是用material studio的。我不太熟悉，可能VASP支持第一原理動(dòng)力學(xué)模擬。不過，我推薦你使用CPMD或者cp2k。 |
2樓2012-10-19 09:34:01
3樓2012-10-19 14:26:23
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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這個(gè)問題要分開熱力學(xué)和動(dòng)力學(xué)。 熱力學(xué)上很好做，對任何一個(gè)體系A(chǔ)(a,b,c,d,e,....)，其中a,b,c,d,e是元素種類，算所有有且僅有全部或部分這些元素化合物的能量，然后算grand canonical gibbs free energy，做不同化學(xué)勢下的相圖，然后分析反應(yīng)途徑。這個(gè)想必大家都知道。 動(dòng)力學(xué)上非常難，目前對氣固反應(yīng)，尤其是吸附-反應(yīng)對的很好了，無非也就是猜過渡態(tài)算activation energy找途徑。液固可以參考?xì)夤痰姆椒�，固固就死了這條心吧，如果你能找到任何非常robust做固固的方法，MIT的faculty position應(yīng)該是輕而易舉能拿到的 |
4樓2012-10-20 15:36:48
5樓2015-07-09 03:12:19
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