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[交流]
大家來說說做southern blot時,基因組DNA的提取方法
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| 做southern blot,對基因組DNA質(zhì)量要求很高...希望大家一起交流下...我現(xiàn)在用CTAB法提取出來的DNA的質(zhì)量還行,就是到酶切的時候基本都要切上24小時以上...希望大家多提意見!謝謝! |
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鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
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DNA抽提緩沖液(lysis buffer):50mM Tris-Hcl(Ph7.2) 50mM EDTA 3% SDS 1% β-巰基乙醇(用時加) 飽和酚:氯仿(V:V,1:1) 異丙醇 3M醋酸鈉NaOAc(Ph8.0) 1. 稱取0.075-0.085g干菌絲置于預(yù)冷的研缽中,加入液氮研磨至細(xì)粉末狀,迅速轉(zhuǎn)至1.5ml的離心管中并加入750μl DNA提取緩沖液(65℃預(yù)熱),在振蕩器上振蕩幾秒鐘充分混勻,然后放到65℃水浴鍋中水浴60min,每10min搖動一次。 2. 加入750μl飽和酚:氯仿(V:V,1:1)輕輕顛倒離心管數(shù)次充分混勻,室溫下12000rpm離心15min,取上清液置于新的離心管中。 3. 加入1/30體積的3M醋酸鈉NaOAc(PH8.0)和0.54體積的異丙醇,輕輕混勻后置于4℃冰箱中30min,室溫下12000rpm離心2min,小心倒掉上清液,然后用冷的70%乙醇洗滌沉淀兩次(輕輕顛倒離心管若干次),倒掉乙醇。 4. 將裝有DNA沉淀的離心管置于真空干燥器中,干燥約30min(時間以DNA變干為準(zhǔn))。 5. 加入500μl的ddH2O溶解DNA沉淀,同時加入1-2μl RNase(終濃度為20μg/ml),37水浴60min。 6. 加入等體積的飽和酚:氯仿(V:V,1:1),充分混勻,然后室溫下12000rpm離心15min,取上清液置于新的離心管中。 7. 重復(fù)步驟3。 8. 重復(fù)步驟4。 9. 加入100ml TE溶解DNA,待完全溶解后置于-20℃冰箱中備用。 |
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