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wanglianli136

鐵桿木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 5 (幼兒園)
金幣: 8377.3
散金: 22
紅花: 14
帖子: 1273
在線: 410.8小時
蟲號: 553939
注冊: 2008-05-05
性別: MM
專業(yè): 半導(dǎo)體材料

[求助] 求助lsf集群上提交lammps任務(wù)的腳本

誰有在lsf集群上并行l(wèi)ammps任務(wù)的腳本�。空埥o我參考一下吧，謝謝

#!/bin/bash

# Simple LSF script for submitting multiple parallel lammps jobs

#-------------------------------------------------------
#-------------------------------------------------------
#
#       <------ Setup Parameters ------>
#
#BSUB -J chetanF
#BSUB -n 4
#BSUB -N -u cmahajan@che.utexas.edu
#BSUB -q normal
#BSUB -o stdout.o%J
#BSUB -e stderr.o%J
#BSUB -W 2:00
#
# Usage:
# #BSUB -n
# #BSUB -W [hours:]minutes to specify run time limit
# #BSUB -J
# #BSUB -q
# #BSUB -o
#    NOTE: The macro %J encodes the job id.
#
cd $LS_SUBCWD
set echo
ibrun ./lmp_lonestar
# lonestar = TACC Dell cluster

SHELL = /bin/sh
.IGNORE:

# System-specific settings

# NOTE: you may need to invoke (by entering in your job-submission script
#  or in your .cshrc file)
# module load libraries/fftw-2.1.5-openmpi-1.1.2-ofed-intel-9.1
# before running LAMMPS.
#
# Additional Note:
# Even when using the OpenMPI build 10.0,
# DO NOT USE: module load libraries/fftw-2.1.5_openmpi-1.2.4_ofed_intel-10.0-f025-c025
# This build of FFTW exhibits fatal memory errors in long runs.

FFTW = /apps/x86_64/libraries/fftw/openmpi-1.1.2-ofed-intel-9.1/fftw-2.1.5

CC = mpicxx
CCFLAGS = -O -DFFT_FFTW -I${TACC_FFTW2_INC}
DEPFLAGS = -M
LINK = mpicxx
LINKFLAGS = -O -L${TACC_FFTW2_LIB}
USRLIB = -lfftw -lstdc++
SYSLIB = -lm
SIZE = size

# Link rule

$(EXE): $(OBJ)
$(LINK) $(LINKFLAGS) $(OBJ) $(USRLIB) $(SYSLIB) -o $(EXE)
$(SIZE) $(EXE)

# Library target

lib: $(OBJ)
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(EXE) $(OBJ)

# Compilation rules

%.o:%.cpp
$(CC) $(CCFLAGS) -c $<

%.d:%.cpp
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@

# Individual dependencies

DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
include $(DEPENDS)

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1樓 2012-11-09 11:58:35

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蒼穹1989

金蟲 (正式寫手)

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注冊: 2012-05-06
專業(yè): 教育學(xué)原理

拿分走人，樓主不要小氣哦！

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2樓2012-11-09 12:17:27

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