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xiaomu0313鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
SeqID是什么
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大家好，我最近正在學(xué)習(xí)如何向GenBank提交序列,我看了相關(guān)的說(shuō)明書(shū)，目前有一問(wèn)題我不理解，向大家請(qǐng)教一下，望高手指點(diǎn)。 在提交序列時(shí)要求提交的序列格式是Fasta，格式如下： >SeqID [org=organism scientific name] [modifier=modifier name] title 我不太清楚SeqID是指什么？ 說(shuō)明書(shū)中對(duì)SeqID的解釋是： SeqID：你對(duì)所提交序列的唯一標(biāo)識(shí)。只有你在核酸頁(yè)上選擇了"FASTA defline starts with sequence ID."選擇鈕之后才需要你填寫(xiě)。這個(gè)名字不能與其它核酸 或蛋白序列的名字重復(fù)。如果你不為它命名，Sequin 將自動(dòng)為它產(chǎn)生唯一標(biāo)識(shí)。 在提交過(guò)程中， 數(shù)據(jù)庫(kù)的工作人員將會(huì)將此標(biāo)識(shí)發(fā)為接收號(hào) （accession number）。若提交的是一系列序列，而其中的一個(gè)已以被 GenBank/EMBL/DDBJ 數(shù)據(jù)庫(kù)接收， 那么你必須將其標(biāo)出， 以避免重新為它編號(hào)。 只需以其接收號(hào)作為標(biāo)識(shí)即可，如 accU12345。 根據(jù)這段話(huà)，我的理解是SeqID就是咱們?cè)贕enBank上搜索序列時(shí)用的登陸號(hào)，也是咱們注冊(cè)序列時(shí)最終想獲取的那個(gè)登陸號(hào)呢？若是，是不是若這個(gè)SeqID是你自己設(shè)計(jì)的而且與目前GenBank上公布的不同，那這個(gè)將來(lái)就是你的序列的登錄號(hào)呢，那提交序列后，Genbank還給發(fā)郵件通知登陸號(hào)嗎？若你不設(shè)計(jì)登陸號(hào)，那是不是由Sequin自動(dòng)產(chǎn)生的標(biāo)識(shí)，最后Genbank在發(fā)郵件通知呢？ 我挺著急的，麻煩懂這方面的高手給指點(diǎn)一下，謝謝！ |
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